新的分子工具来找出成千上万的细胞之间的DNA突变

科学家们设计了一种新的分子工具，被称为“LigAmp”，要找准成千上万的细胞之间的DNA突变，相当于寻找一个单错字在整个图书馆的书籍。在少数细胞株和体液的初步研究表明，超灵敏的测试可以帮助检测微观癌症和艾滋病病毒耐药性。

“其他分子检测，很难找到在一个特定的细胞周围数以千计的其他细胞，没有突变突变，​​”詹姆斯说Eshleman，医学博士，哲学博士，谁领导与同事的研究病理学和Kimmel癌症中心的 的约翰霍普金斯大学部。 “LigAmp基本上过滤背景”噪音“正常细胞造成，并揭示特定的突变。”

研究人员说，敏感的测试，以找出突变可能确定疾病的高风险的癌症患者。这种测试，甚至可以帮助检测监测突变的数量是否高于一个预定的阈值值上升的癌症复发。

除了癌症检测，霍普金斯大学的突变测距仪出现能够检测艾滋病毒的抗药性。团队测试血液样本从少数患者与艾滋病毒和病毒本身，使之耐一定的抗逆转录病毒药物在位于DNA的错误。新的测试分析结果发表在11月的“自然方法问题。

“我们设计LigAmp的，以改善我们如何看待病毒和细胞的DNA中极其细微的变化，说：”Eshleman，病理学和肿瘤学副教授，并在约翰霍普金斯大学的DNA诊断实验室副主任。 “正常细胞的分子代码可能看起来相同，除了在DN​​A梯状结构单一梯级癌变。”

测试工程，通过创建一个分子的“磁石”与亲和力的DNA错误，也作为一个点突变。如果基因突变被发现，磁铁它结合并插入一种细菌基因。细菌基因作为一个红色的标志，并产生了强大的计算机程序可见的荧光色。

在他们的研究中，霍普金斯大学的研究人员测试了对结肠癌细胞株，从艾滋病患者的血液，从癌症患者的胰腺管中的流体的LigAmp。在结肠癌细胞和耐药的HIV病毒单基因突变进行检测稀释高达1万分子。从三个胰腺癌患者，这也相当于在他们的肿瘤中发现的突变的KRAS2基因突变检测管流体样品。 LigAmp也设一个耐药性的突变，称为K103N在血液样本从三个艾滋病患者，。

较大的样本量和临床标本的盲板LigAmp进一步分析目前正在进行中。

“一些初步的研究表明，我们可以同时寻找不同的突变和量化突变分子的数量，这可能帮助我们建立肿瘤标志物筛选小组，并确定突变的高或低的水平。”

资助这项研究是由马里兰州卷烟归还基金，国家癌症研究所和国家过敏和传染病研究所提供。

约翰霍普金斯大学的同事与Eshleman工作Chanjuan石，苏珊Eshleman，达纳 - 琼斯，则义福岛，李华，安东尼 - 帕克，查尔斯杨，拉尔夫Hruban，和迈克尔戈金斯。

http://www.hopkinsmedicine.org/