연구원은 암 유전자의보다 정확한 검색을 초래할 수있는 새로운 알고리즘을 개발

에서 연구자 뉴욕 대학의 수학 과학 Courant 연구소는 이전 버전보다 암 유전자의보다 정확한 검색을 초래할 수있는 새로운 알고리즘을 개발했습니다.

과학의 국립 아카데미 (PNAS)의 논문집의 최신 월호에 발표된 알고리즘은 암 환자 'genomes을 분석하는 데 사용되는 여러 생물 의학 기술 (예, 마이크로 어레이의 종류)에도 적용할 수 있습니다.

NYU 교수 버드 Mishra로 가고, 연구팀은 정상 세포와 암세포 사이의 유전적 차이를 감지하는 알고리즘을 개발했습니다. 애플 리케이션은 여러 초과뿐만 아니라, 다양한 암의 형태와 oncogenes와 종양 억제 유전자 모두의 위치를​​ 궁극적으로, 포인트와 관련된 DNA 세그먼트의 누락된 사본을 보여줍니다. 또한, 알고리즘은 인간의 인구에 걸쳐 존재하는 다양한 genomes에 대한 계정을 사용할 수 있습니다.

알고리즘뿐만 아니라 여러 다른 경쟁 알고리즘의 이전 버전은 암 데이터 또는 전용 다형성 데이터를 다루는 능력이되었으며 단일 프레임 워크로 암 및 비 암 유전자에서 별도의 유사하지 못했습니다.

NYU의 Bioinfomatics 그룹을 형성 Mishra의 팀은, 이전에 매핑 및 암 관련 단일 분자, 게놈 진화의 모델, 그리고 apoptosis와 같은 생물 학적 과정의 전산 및 시스템 생물학 모델, 세포 분열, 그리고 다른 사람과 시퀀싱을위한 새로운 게놈 기술을 검사했습니다.

생물 정보학 그룹, 라울 - 샘 Daruwala과 Archisman Rudra에서 두 수석 연구 과학자들은 알고리즘을 고안하고 소프트웨어 구현을 만들 수 Mishra과 협력. Daruwala, Rudra, 그리고 Mishra는 콜드 스프링 하버 연구소와 의학의 NYU 학교에서 동료에 의해 연구에 합류했다.

이 알고리즘은 과학, 기술 및 학술 연구 (NYSTAR) 부여의 뉴욕주 사무소의 도움으로, Valis, 2001 년 Mishra 및 Courant의 살바토레 Paxia 개발한 소프트웨어 환경을 통해 실행됩니다. 소프트웨어는 12 월 중순에서 온라인 사용할 수 있습니다. 이 연구는 육군에 의해 투자되었다 전립선 암 연구 프로그램 (PCRP).

http://www.nyu.edu/