Sebuah tim peneliti dipimpin oleh Terumi Kohwi-Shigematsu dari Divisi Ilmu Lawrence Berkeley National Laboratory telah mengidentifikasi sebuah gen, DLX5, yang mungkin memainkan peran dalam patologi Rett Syndrome, gangguan neurologis yang menghancurkan didiagnosis hampir secara eksklusif pada anak perempuan. Temuan mereka dilaporkan dalam edisi Januari Nature Genetics dan online saat ini tersedia. Tim juga menemukan bahwa Sindrom Rett dikaitkan dengan gangguan tiga-dimensi lipat kromatin.
Anak-anak dengan Sindrom Rett (RTT) tampaknya berkembang secara normal sampai 6 sampai 18 bulan usia, ketika mereka memasuki masa regresi, kehilangan berbicara dan keterampilan motorik. Kebanyakan mengembangkan gerakan tangan berulang-ulang, pola pernapasan tidak teratur, kejang dan masalah motor kontrol. RTT daun korbannya sangat cacat, membutuhkan bantuan maksimum dengan setiap aspek kehidupan sehari-hari.
Mutasi pada gen yang disebut MECP2 (metil CpG-binding protein 2) telah diidentifikasi pada tahun 1999 sebagai penyebab utama RTT. MECP2 diyakini berfungsi sebagai represor transkripsional gen hilir. Ketika gen harus dibungkam sehingga protein tidak diproduksi dalam sel yang diberikan, kelompok metil melampirkan dinucleotides CpG, yang sering berkerumun di daerah-daerah gen yang disebut pulau CpG. MECP2 kemudian mengikat ke situs-situs CpG alkohol, mematikan produksi gen protein nya.
Rusak over-ekspresi gen target yang disebabkan oleh MeCP2 bermutasi merupakan hipotesis yang mendasari menjelaskan gejala RTT. Meskipun MeCP2 dinyatakan seluruh tubuh, RTT adalah gangguan sistem saraf pusat dan oleh karena itu sangat penting untuk mengidentifikasi sasaran yang MECP2 gen di otak.
Dr Kohwi-Shigematsu dan rekan telah mengidentifikasi sebuah gen MECP2 target, DLX5, yang terlibat dalam sintesis GABA, asam gamma-aminobutyric, suatu neurotransmitter penting. Menariknya, DLX5 adalah gen dicantumkan, berarti statusnya ekspresinya tergantung pada apakah gen berasal dari ibu atau ayah. Misregulation gen dicantumkan telah terlibat dalam beberapa gangguan neurologis. Dr Kohwi-Shigemtsu menemukan bahwa pasien dengan RTT memiliki dua kali jumlah normal DLX5. Tim kemudian berusaha untuk menentukan bagaimana yang normal MeCP2 mengatur gen DLX5 dan bagaimana peraturan ini berjalan kacau di RTT.
Dalam twist yang tak terduga, para ilmuwan menemukan bahwa metilasi pulau CpG tidak berdampak terhadap ekspresi DLX5. Bahkan, pulau-pulau CpG terkait dengan DLX5 yang unmethylated di kedua alel paternal. Beberapa mekanisme lain karena harus bertanggung jawab.