Eine Universität-Geführte Entwicklung Oregon-Gesundheit u. -wissenschaft einer Technik für das Kennzeichnen von Reglern, die den Ausdruck von Genen in den Gehirnzellen treiben, könnte das Krankheit-kämpfende Potenzial des viel-gehagelten menschlichen Genoms losbinden.
Wissenschaftler am Institut OHSU Vollum, das die multidisziplinäre Studie voranging, die in der Ausgabe Am 29. Dezember der Zapfen Zelle erscheint, nennen den Anflug einen beträchtlichen Fortschritt, wenn sie das Genom verstehen.
Der des Vollums Direktor, Richard Goodman, M.D., Ph.D., Professor der Zelle und der Entwicklungsbiologie und der Biochemie- und Molekularbiologie, OHSU-Medizinische Fakultät, sagte, dass die Technik einen kritischen Auftrieb zur neuen Ära der genomischen Entdeckung geben könnte festgelegt, als das Humangenomprojekt letztes Jahr beendetes frühes war.
„Die Frage war, wie man die enorme Menge von genomischen Informationen, die erzeugt worden ist,“ Goodman sagte versteht. „Unser Anflug hilft, die Reglementierung des Genoms freizusetzen.“
Der Anflug könnte Verständnis der Bahnen hinter genetischen Abweichungen erhöhen, die Diabetes verursachen, Parkinson-Krankheits-, Innerekrankheit, Krebs und andere Krankheiten, sagte er.
Die Technik des Vollum-Teams, entwickelt gemeinsam mit Wissenschaftlern an Brookhaven-Nationalem Laboratorium in Upton, in N.Y. und in der Staatlichen Universität von New York, Steiniger Bach, resultiert aus einer Bemühung durch Soren Impey, Ph.D., in Goodmans Labor, eine Familie von den Genen zu kennzeichnen geregelt durch das bindene“ Protein „des Lagerwarteelements oder CREB. Dieses gut-gekennzeichnete Molekül gehört zu einer Gruppe Proteinen, die Übertragungsfaktoren genannt werden, die auf regelnde Elemente in DNS einwirken, die für das Erhöhen oder die Verringerung des Niveaus der Genexpression in den Zellen verantwortlich sind.
Die Technik bezieht, DNS von einer Zelle mit dem Übertragungsfaktorprotein zu verbinden, dann mit ein den Komplex durch einen Prozess zu trennen, der Immunopräzipitation genannt wird. Streifen von 21 Nukleotid-lange DNS werden dann von der immunoprecipitated DNS freigegeben, um „genomische Unterzeichnungswarnschilder herzustellen,“ werden die dann in der internationalen Genomdatenbank gekennzeichnet. Die Methode stellte ungefähr 6.300 regelnde Regionen fest, die zu den eindeutigen Sites auf dem Genom abbildeten.
„Eine Teilmenge dieser Regionen markieren neue Gene,“ sagte Impey, Assistenzprofessor von Neurologie, VON OHSU-Medizinischer Fakultät und von führenden Autor der Studie.
Goodman nennt den Prozess „die umfassendste Analyse bis jetzt in einer metazoan Anlage - d.h., eine mehrzellige Anlage - von, wo Übertragungsfaktoren binden an ihre genomischen Ziele.“ Es gibt Wissenschaftlern eine Anlage für das Bergbau des gesamten Genoms nach allen regelnden Sites, die ein gegebenes Übertragungsfaktorprotein mit einbeziehen.
„Sie können beginnen, eine transcriptional Karte von Bahnen zusammenzufügen, die in zelluläre Funktion miteinbezogen werden,“ er sagten. „In der Vergangenheit, wird sie nur möglich gewesen, ein sehr kleines Teil des Genoms zu betrachten, aber jetzt können wir die ganze Sache betrachten. Es ist ein großer Schritt nach vorn.“
David Ginty, Ph.D., Professor von Neurologie an der Universität John Hopkins-Medizinischen Fakultät in Baltimore, molekulare Regelung der Studien vom Wachstum und Überleben von Neuronen im sich entwickelnden fest gefügten Nervensystem als Howard Hughes Medical Institute-Forscher. Er sagte, dass die Herausforderung zur Ausnutzung des menschlichen Genoms, die Verhältnisse zwischen gekennzeichneten Genen festzustellen und zu verstehen gewesen ist, wie komplexe Muster der Genexpression stattfinden.
Aber die Entdeckung des Goodman-Labors, sagte Ginty, wird Wissenschaftler zu verstehen, wie Übertragungsfaktoren komplexe genetische Muster, helfen koordinieren und deshalb wie verschiedene Zellen gemacht werden und wie sie arbeiten.
„Die Studie legt einen schön einfachen Anflug zum Kennzeichnen von Vorrichtungen der komplexen genomischen Regelung fest,“ sagte er. „Die Methode sollte prüfen nützlich für das Festlegen, wie Sets Gene AN/AUS in irgendeinem gegebenen Zellbaumuster gedreht werden und wie zelluläre und Funktionsverschiedenartigkeit wird erzielt.“
Erforschung des menschlichen Genoms ist seit dem Internationalen Menschlichen Genom fieberhaft gewesen, welches das Konsortium Sequenziell Ordnet, geführt in den Vereinigten Staaten vom Nationalen Menschliches Genom-Forschungsinstitut und vom Energieministerium, und das Institut für Genomische Forschung (TIGR), ein privates Genom, das Firma sequenziell ordnet, kündigte die Fertigstellung des Humangenomprojekts mehr als zwei Jahre vorfristig im April 2003 an. Zwischen 20.000 und 25.000 Genen, die für Proteine codieren, die durchführen, wurden die meisten, Lebenfunktionen gefunden. Aber es gab ein Problem.
„Das nicht sehr viele Gene ist,“ sagte Goodman. „Und das Genom so auf eine Weise war zu erklären, das gelöst wurde, ein wenig willkürlich, weil es gelöst hat, wann Sie es wirklich verstehen. Wenn Sie das Genom oder die Datenbank betrachten, die das bereitgestellte Genom, was Sie haben ein Bündel Schreiben ist und es muss decodiert werden, um zu verstehen, was jene Schreiben bedeuten.“
Goodman verglich das Genom mit einem Telefonbuch, in dem die Namen „mit vielen Unsinnsschreiben vermischt wurden,“ und die Namen selbst waren in Stücke gebrochen. „Und eher als, 26 Schreiben habend, gibt es nur vier, und alle sie werden oben gemischt,“ sagte er. „Es ist hart, zu wissen, wo die Gene beginnen und stoppen.“