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ヒトゲノムの理解の重要な前進

Published on December 28, 2004 at 5:34 PM · No Comments

脳細胞の遺伝子の表現を運転する制御要素を識別するための技術のオレゴン健康及び科学の大学主導の開発は十分に呼ばれたヒトゲノムの病気戦いの潜在性を自由にすることができます。

ジャーナルセルの 12 月 29 日の版で現われる学際的な調査の先頭に立った OHSU Vollum の協会の科学者はアプローチをゲノムの理解の重要な前進と呼出しています。

ヒトゲノムプロジェクトが去年完了された早かったときに技術が述べられた genomic 発見の新しい時代に重大な倍力を与えることができることをセルおよび進化の生物学および生物化学および分子生物学、 OHSU の医科大学院の Vollum のディレクター、リチャードグッドマン、 M.D.、 Ph.D。、教授は、言いました。

「質問生成された genomic 情報の巨大な量を理解する方法をと」、はグッドマン言いましたでした。 「私達のアプローチゲノムの取締管理をロック解除するのを助けます」。は

アプローチは、パーキンソン病、心臓病、癌および他の病気糖尿病を引き起こす遺伝の異常の後ろのパスの理解を高めることができますと、彼は言いました。

ニューヨークの 「キャンプ応答要素結合の」の蛋白質、か CREB によって調整される遺伝子の系列を特徴付けるためのグッドマンの実験室のゾーレン Impey、 Ph.D 著努力に。、起因する石の小川の Upton、ニューヨークおよび州立大学の Brookhaven の国立研究所で科学者と共同して開発される Vollum のチームの技術。 この十分特徴付けられた分子はセルの遺伝子発現のレベルを増加するか、または減らすために責任がある DNA の規定する要素と相互に作用しているトランスクリプション要因と呼出される蛋白質のグループの中にあります。

技術はセルからの DNA をトランスクリプション要因蛋白質とリンクすることを、そして免疫沈降法と呼出されるプロセスによって複合体を隔離することを含みます。 21 ヌクレオチドの長さの DNA のストリップは immunoprecipitated DNA からそれから 「genomic 署名の札作成するために解放されます」を国際的なゲノムのデータベースでそれから識別されます。 方法はゲノムの個別のサイトにマップした約 6,300 の規定する領域の覆いを取りました。

「これらの領域のサブセット新しい遺伝子を強調します」、は神経学の Impey、助教授、 OHSU の医科大学院、および調査の主執筆者を言いました。

グッドマンはトランスクリプション要因が genomic ターゲットに」。とどこにの結合するかプロセスを 「metazoan システム - すなわち、多細胞システム - の包括的な分析今までに呼出します それは科学者にある特定のトランスクリプション要因蛋白質を含むすべての規定するサイトのために全体のゲノムを採鉱するためのシステムを与えます。

「と」、彼言いました細胞機能にかかわるパスの transcriptional マップをまとめ始めることができます。 「以前、ゲノムの非常に小さい部分を見ることは可能ですしかし今私達は何もかも全部を見てもいいです。 それはです大きい一歩前進」。

ボルティモアのジョーンズ・ホプキンス大学の医科大学院の神経科学のデイヴィッド Ginty、 Ph.D。、教授、調査のハワード・ヒューズの医学の協会の調査官として成長の脊椎動物の神経系のニューロンの成長の分子制御および存続。 彼はヒトゲノムの開発への挑戦がずっと識別された遺伝子間の関係の覆いを取り、遺伝子発現の複雑なパターンがどのように起こるか理解することであることを言いました。

しかしグッドマンの実験室の発見は、従って Ginty は言いましたり、異なったセルがどのようになされる、そしてどのように作用するか科学者がトランスクリプション要因が複雑な遺伝パターンをどのように調整するそして助けますか理解するのを。

「調査複雑な genomic 制御のメカニズムの識別に美しく簡単なアプローチを確立します」はと彼は言いました。 「方法遺伝子のセットがある特定のセルタイプでオン/オフどのように回る、そしてどのように細胞および機能多様性が」。は達成されるか確立するために有用証明するべきです

慈悲深いゲノムの調査は各国用のヒトゲノムの研究所そしてエネルギー省によって米国で導かれる借款団を配列する国際的なヒトゲノム以来熱狂的であり Genomic 研究 (TIGR) のための協会、会社を配列する私用ゲノムは 2 年以上ヒトゲノムプロジェクトの完了を 2003 年 4 月のスケジュールに先んじる発表しました。 行う蛋白質のためにコードする 20,000 そして 25,000 の遺伝子間でほとんどの生命機能は見つけられました。 しかし問題がありました。

「あまり遺伝子ではないと」、グッドマンは言いました。 「そう、実際的な意味で、解決したゲノムを宣言することは実際にそれをいつ理解するか解決したので幾分任意であり。 ゲノムを、か提供されるゲノムがある何が束文字のそれらの文字が」。意味するものを理解することをおよびであるデータベースを見れば解読しなければなりません

グッドマンは名前が多くのナンセンスの文字と 「散在していた電話帳とゲノムを比較し」、名前自身は部分に壊れました。 「26 の文字を持っていてよりもむしろ、 4 だけがあり、すべて混合されます」と彼は言いました。 「遺伝子がどこに」。開始し、停止するか確認することは困難です