Nauka Prowadzący rozwój technika dla utożsamiać kontrolnych elementy które jadą wyrażenie geny w komórkach mózgowych & mogli spuszczać ze smyczy boju potencjał witający ludzki genom.
Naukowowie przy OHSU Vollum instytutem dzwonią podejście znaczący postęp w rozumieć genom., który przewodził multidisciplinary naukę pojawiać się w Dec. 29 wydaniu czasopismo komórka,
Vollum's dyrektor, Richard dobry człowiek, M.D, Ph.D, profesor komórka, rozwojowa biologia i biologia., biochemii i cząsteczkowej, OHSU szkoła medyczna, powiedzieliśmy technika mógł dawać krytycznemu zwiększeniu nowa era ustawiająca naprzód genomic odkrycie gdy Ludzkiego genomu projekt był uzupełniający wczesny w zeszłym roku.
"pytanie był dlaczego rozumieć ogromną kwotę genomic informacja która wytwarzał," Dobry człowiek powiedział. "Nasz podejście pomaga otwierać wykonawczą kontrola genom."
Podejście mógł wzmagać zrozumienie drogi przemian za genetycznymi aberracjami które powodują cukrzyce, Parkinson choroba, kierowa choroba, nowotwór i inne choroby, powiedział.
Vollum drużyny technika, rozwijać we współpracy z naukowami przy Brookhaven narodowym laboratorium w Upton, N.Y. i stanu uniwersytecie Nowy Jork, Kamienisty strumyk, wynikający od wysiłku Soren Impey, Ph.D., w dobrego człowieka laboratorium charakteryzować rodziny geny regulujący proteiną lub CREB "obozowej odpowiedź elementu oprawy". Ten charakteryzująca molekuła jest wśród grupy proteiny dzwonić transkrybowanie czynniki które oddziałają wzajemnie z wykonawczymi elementami w DNA które są odpowiedzialni dla wzrastać poziom genu wyrażenie w komórkach lub zmniejszać.
Technika wymaga łączyć DNA od komórki z transkrybowanie czynnika proteiną, odizolowywać kompleks przez proces nazwanego immunoprecipitation, then. Paski 21 długi DNA wtedy uwalniają od immunoprecipitated DNA tworzyć "genomic podpis etykietki," które wtedy utożsamiają w międzynarodowej genom bazie danych. Metoda odkrywał wokoło 6.300 wykonawczych regionów które kartografowali odrębni miejsca na genomu.
"podzbiór te regiony podkreśla nowatorskich geny," powiedział Impey, asystent profesora neurologia, OHSU szkoła medyczna i nauka wiodący autor.
Dobry człowiek dzwoni proces "całościowa analiza w wielokomórkowiec systemu który jest do teraz -, wielokomórkowy system - dokąd transkrybowanie czynniki oprawiają ich genomic cele." Ja daje naukowom systemowi dla minować całkowitego genom dla wszystkie wykonawczych miejsc wymaga dawać transkrybowanie czynnika proteinę.
"Ty możesz zaczynać stawiać wpólnie transcriptional mapę drogi przemian które wymagają w komórkowej funkci," on powiedziałeś. "W przeszłości, ja tylko jest ewentualny patrzeć bardzo małą część genom, ale teraz patrzeć całą rzecz możemy. Ja jest dużym krokiem naprzód."
David Ginty, Ph.D, profesor neuroscience przy Johns Hopkins Uniwersytecką szkołą medyczną w Baltimore, studia cząsteczkowa przyrost neurony w rozwija kręgowiec układzie nerwowym jako howard hughes medical institute oficer śledczy kontrola i przetrwanie. Powiedział wyzwanie wykorzystywać ludzkiego genom był odkrywać związki między utożsamiającymi genami i rozumieć jak powikłani wzory genu wyrażenie mieli miejsce.
Ale dobrego człowieka lab odkrycie, Ginty, różne komórki zrobią i funkcjonują. powiedział naukowów, pomaga rozumieć transkrybowanie wskazuje czynniki równorzędnych powikłanych genetycznych wzory, tym samym,
"nauka ustanawia pięknie prostego podejście utożsamiać mechanizmy powikłana genomic kontrola," powiedział. "metoda musi udowadniać pożytecznie dla ustanawiać jak, jak sety geny obracają dalej daleko w jakaś dawać komórce lub typ, i komórkowa i czynnościowa różnorodność dokonuje."
Eksploracja humanitarny genom był desperacka od Międzynarodowego Ludzkiego genomu Uporządkowywa konsorcjum, prowadzącego w Stany Zjednoczone Krajowym Ludzkiego genomu instytutem badawyczy i departamentem energetyki, i instytut intymny genom uporządkowywa firmy dla Genomic badania, ogłaszał ukończenie Ludzkiego genomu projekt bardziej niż dwa roku naprzeciw rozkładu w Kwietniu 2003. (TIGR) Między 20.000 i 25.000 genami koduje dla protein które wykonują najwięcej życie funkcj znajdowali. Ale tam był problem.
"Który no jest prawdziwy wiele geny," Dobry człowiek powiedział. "I w ten sposób, w sensie był nieco arbitralny, oznajmiać genom rozwiązuje ponieważ ono rozwiązywał kiedy ty naprawdę rozumiesz je. Jeżeli ty patrzejesz genom lub bazę danych którą wiązką listy jest genom provided, i, co ty ja musi odszyfrowywający rozumieć co znaczą tamte listy."
Dobry człowiek porównywał genom telefon książka w którym poprzekładali imiona "z mnóstwo ambajów listami," i imiona themselves łamali w kawałki. "I raczej niż mieć 26 listów są tylko cztery, tam, i wszystko mieszają up," powiedział. "Ja jest ciężki znać dokąd geny zaczynają i zatrzymują."