Здоровье & Наука Орегона Университет-Вели развитие метода для определять элементы управления которые управляют выражением генов в клетках головного мозга смогли развязатьть заболевани-воюя потенциал много-окликнутого людского генома.
Научные Работники на Институте OHSU Vollum, который возглавил multidisciplinary изучение появляясь в варианте 29-ое декабря Клетки журнала, вызывают подход значительно выдвижением в понимать геном.
Директор Vollum, Глава семьи Ричарда, M.D., Ph.D., профессор клетки и отработочной биологии, и биологии биохимии и молекулярных, Медицинского Факультета OHSU, сказали что метод смог дать критическое подталкивание к новой установленной эре genomic открытия когда Проект Людского Генома был завершенные предыдущими в прошлом году.
«Вопрос был как понять преогромный объем genomic информация которая была произведена,» Глава семьи сказал. «Наш подход поможет открыть регламентационное управление генома.»
Подход смог повысить вникание тропа за генетическими аберрациями которые причиняют мочеизнурение, заболевание Parkinson, сердечная болезнь, рак и другие заболевания, он сказал.
Метод команды Vollum, начатый в сотрудничестве с научными работниками на Лаборатории Брукхейвен Национальной в Upton, N.Y., и Государственном Университете Нью Йорка, Каменистого Ручейка, приведенного к от усилия Soren Impey, Ph.D., в лаборатории Главы семьи характеризовать семейство генов отрегулированных «протеином элемента реакции лагеря связывая», или CREB. Эта, котор хорошо-характеризуют молекула среди группы в составе вызванные протеины факторами транскрипции которые взаимодействуют с регламентационными элементами в ДНА которые ответствены для увеличивать или уменьшать уровень выражения гена в клетках.
Метод включает соединить ДНА от клетки с протеином фактора транскрипции, тогда изолировать комплекс через вызванный процесс иммунопреципитацией. Прокладки нуклеотид-длиннего ДНА 21 после этого выпущены от immunoprecipitated ДНА для того чтобы создать «genomic бирки подписи,» которые после этого определены в международной базе данных генома. Метод расчехлил около 6.300 регламентационных зон которые отобразили к определенным местам на геноме.
«Подсовокупность этих зон выделяет романные гены,» сказал Impey, ассистента профессора неврологии, Медицинского Факультета OHSU, и ведущего автор изучения.
Глава семьи вызывает процесс «большинств всесторонним анализом для того чтобы датировать в metazoan системе - т.е., мультиячейковой системе - где факторы транскрипции связывают к их genomic целям.» Она дает научным работникам систему для минировать весь геном для всех регламентационных мест включая, котор дали протеин фактора транскрипции.
«Вы можете начать положить совместно transcriptional карту тропа которые включаются в клетчатую функцию,» он сказали. «В прошлом, только возможно посмотреть очень малую часть генома, но теперь мы можем посмотреть целую вещь. Большое шаг вперед.»
Дэвид Ginty, Ph.D., профессор нейронауки на Медицинском Факультете Университета Джонаа Хопкинсаа в Балтиморе, управление изучений молекулярное роста и выживание невронов в превращаясь vertebrate слабонервной системе как исследователь Института Говарда Hughes Медицинский. Он сказал что возможность к эксплуатировать людской геном расчехлить отношения между определенными генами и понять как сложные картины выражения гена осуществляют.
Но открытие лаборатории Главы семьи, Ginty сказало, поможет научным работникам понять как факторы транскрипции координируют сложные генетические картины и, поэтому, как различные клетки сделаны и как они действуют.
«Изучение устанавливает красивейше простой подход к определять механизмы сложного genomic управления,» он сказал. «Метод должен доказать полезно для устанавливать как комплекты генов повернуты включено-выключено в любом, котор дали типе клетки, и как достигана клетчатая и функциональная разнообразность.»
Исследование гуманного генома взбешённый с Международного Людского Генома Sequencing Консорциум, водить в Соединенные Штаты Национальным Научно-исследовательским Институтом Людского Генома и Министерством Энергетики, а Институт для Genomic Исследования (TIGR), приватный геном sequencing компания, объявил завершение Проекта Людского Генома больше чем 2 лет раньше расписания в апреле 2003. Между 20.000 и 25.000 генами кодируя для протеинов которые выполняют были найдены большинств функции жизни. Но была проблема.
«Которое нет очень много генов,» Глава семьи сказала. «И так, в некотором смысле, объявлять разрешенный геном был несколько произвольн потому что оно разрешал когда вы действительно понимаете его. Если вы смотрите геном, или базу данных, то которой обеспеченный геном, чего вы имеете пук писем и оно должно быть расшифровано для того чтобы понять чего те письма значат.»
Глава семьи сравнила геном к книге телефона в которой имена были interspersed «с много письмами вздора,» и имена сами были сломаны в части. «И вернее чем имеющ 26 писем, только 4, и они все смешаны вверх,» он сказал. «Трудно знать где гены начинают и останавливают.»