En Vård- Oregon & Vetenskap Universitetar-Ledde utveckling av en teknik för att identifiera kontrollmoment som kör uttryckt av gener i hjärnceller kunde släppa loss sjukdom-stridigheten som är potentiell av denhailed människagenom.
Forskare på Institutet för OHSU Vollum, som hövdat den tvärvetenskapliga studien som visas i den Dec. 29 upplagan av föra journal överCellen, kallar att närma sig ett viktigt för- i överenskommelse genom.
Vollum'sens direktör, den Richard Husfadern, M.D., Ph.D., professorn av cellen och utvecklings- biologi, och molekylär biologi för biochemistry och, OHSU Skolar av Medicin, sade att tekniken kunde ge en kritisk ökning till den nya eraen av den genomic upptäcktuppsättningen framåt, då MänniskaGenom Project var den avslutade tidig sort i fjol.
”Var ifrågasätta hur man förstår det jättelika beloppet av genomic information, som har frambragts,” Husfader sade. ”Vårt att närma sig ska hjälp låser det reglerande upp kontrollerar av genom.”,
Att närma sig kunde göra hög överenskommelse av banorna bak genetiska avvikelser, som orsakar sockersjuka, Parkinsons sjukdom, hjärtsjukdomen, cancer och andra sjukdomar, sade han.
Det Vollum lagets teknik som framkallas i samarbete med forskare på det Brookhaven MedborgareLaboratoriumet i Upton, N.Y. och Delstatsuniversitet av New York, Stenig Bäck som resulteras från ett försök av Soren Impey, Ph.D., i Husfader laboratorium att karakterisera en familj av gener som regleras av det bindande” proteinet ”för lägersvarsbeståndsdel eller CREB. Denna brunn-karakteriserade molekyl är bland en grupp av proteiner som kallas transkription, dela upp i faktorer att påverka varandra med reglerande beståndsdelar i DNA som är ansvariga för ökande eller minskning det jämnt av genuttryckt i celler.
Tekniken gäller att anknyta DNA från en cell med transkriptionen dela upp i faktorer protein, då isolering av komplex till och med en processaa kallad immunoprecipitation. Remsor av nucleotide-lång DNA 21 är därefter utsläppt från den immunoprecipitated DNAEN att skapa ”det genomic häftet märker,”, identifieras som därefter i landskampgenomdatabasen. De avtäckta omkring 6.300 reglerande regionerna för metod som kartlade till distinkt platser på genom.
”Markerar en underdel av dessa regioner nya gener,”, sade Impey, assistentprofessor av neurology, Skolar OHSU av Medicin och studie bly- författare.
Husfaderappeller som det processaa ”den mest omfattande analysen i ett metazoan system - dvs., ett multicellular system - av, var transkription dela upp i faktorer röra till deras genomic uppsätta som mål hitintills.”, Den ger forskare som ett system för att bryta den hela genom för alla reglerande platser som gäller en given transkription, dela upp i faktorer protein.
”Kan Du starta att sätta tillsammans ett transcriptional kartlägger av banor som är involverade i cell- fungerar,”, sade han. ”I förflutnan, vars den endast möjligheten som ser en mycket liten del av genom, men nu kan vi se det hela tinget. Det är ett stort kliver framåtriktat.”,
David Ginty, Ph.D., professor av neuroscience på Den Johns Hopkins Universitetar Skolar av Medicin i Baltimore, kontrollerar molekylära studier av tillväxt och överlevnad av neurons i den framkallande vertebrate nervsystemet som Howard Hughes en Medicinsk Institututredare. Han sade att utmaningen till att exploatera människagenom har varit att avtäcka förhållandena mellan identifierade gener och att förstå hur komplex mönstrar av genuttryck äg rum.
Men Husfaderlabb upptäckt, sade Ginty, ska hjälpforskare förstår, hur transkription dela upp i faktorer koordinerat komplext genetiskt mönstrar och, därför, hur olika celler göras och hur de fungerar.
”Upprättar studien ett beautifully enkelt att närma sig till att identifiera mekanism av komplext genomic kontrollerar,”, sade han. ”Bör metoden bevisa användbart för upprättande hur uppsättningar av gener vänds 'På/av' i någon given celltyp, och hur cell- och funktionell mångfald uppnås.”,
Utforskning av den humana genom har varit frenzied efter Konsortiet för Ordnande i viss följd för LandskampMänniskaGenom, ledde i Förenta staterna vid Forskningsinstitut för MedborgareMänniskaGenom och Avdelningen av Energi, och Institutet för Genomic Forskning (TIGR), ett privat genomordnande i viss följdföretag, meddelade att avslutningen av MänniskaGenom Projekterar mer än två år framåt av schema i April 2003. Mellan 20.000 och 25.000 gener som kodifierar för proteiner, som utför, fungerar mest liv fanns. Men det fanns ett problem.
”Som inte är mycket många gener,” sade Husfader. ”Och så, i en avkänning, var förklaring av den lösta genom något godtycklig, därför att den har löst när du förstår egentligen den. Om du ser genom, eller databasen, som den förutsatt att genom, vad du har är en grupp av, märker och, det måste att avkodas för att förstå vad de märker medel.”,
Husfadern jämförde genom till en telefonkatalog som namnger i interspersed ”med en raddanonsens märker,”, och namnger sig var brutet in i lappar. ”Och ganska än ha 26 märker, finns det endast fyra, och de är alla blandat övre,”, sade han. ”Är Det hårt att veta var generna startar och stoppar.”,