In un nuovo studio, i ricercatori presentano “un racconto ammonitore„ circa che cosa può andare male quando usando la scienza del principiante del proteomics per inventare un test diagnostico per cancro.
Nell'edizione del 16 febbraio del Giornale dell'Istituto Nazionale contro il Cancro, i ricercatori Dal Centro del Cancro dell'Università del Texas il M. il D. Anderson dettagliano perché una prova sperimentale progettata per identificare il cancro ovarico in anticipo da un piccolo campione di sangue è improbabile da piombo ad una prova clinica affidabile subito.
Dopo la conduzione degli assegni ripetuti dei dati che hanno supportato l'efficacia della prova, i ricercatori dicono che i loro risultati indicano che i reclami circa l'analisi a base di proteine sperimentale non sono biologicamente plausibili.
“Osserviamo questo come racconto ammonitore. Se non state attento con questa nuova tecnologia, di cui i capricci completamente non capiamo, potete trovare i risultati che possono essere dovuto qualcosa all'infuori di biologia,„ dite l'autore principale dello studio, Keith Baggerly, il Ph.D., un professore associato nel Dipartimento della Biostatistica & la Matematica Applicata.
Aggiunge che questo studio “illustra la necessità per i ricercatori di fissare gli standard da cui condurre ricerca di proteomics,„ significato che i protocolli in questione in queste indagini dovrebbero essere comuni attraverso i laboratori in moda da potere verificare i risultati da un laboratorio da altri.
“Stiamo muovendo in quella direzione,„ aggiunge. “La tecnologia che è usando per sviluppare vari test diagnostici proteomic sta migliorando e stiamo ottenendo i risultati più riproducibili.„
I Ricercatori universalmente sono eccitati circa la nozione di usando la proteina “codici a barre„ per identificare i diversi cancri prima che i sintomi compaiano, ma Baggerly ed altri mantengono che la promessa di questo campo di emergenza del proteomics ancora non è stata incontrato dovuto la difficoltà nell'individuazione dei reticoli complessi e riproducibili delle proteine.
Secondo Baggerly, quello ora sembra essere il caso con la prova sperimentale del cancro ovarico in questione, che in primo luogo è stato proposto nel 2002 dai ricercatori nel giornale, Lancetta. Quello studio ha riferito i risultati drammatici facendo uso di spettrometria di massa per cercare un reticolo delle proteine nel sangue. In parecchi insiemi dei campioni accecati, la prova ha individuato tutti i pazienti che hanno avuti cancro ovarico e soltanto ha mal diagnosticato tre persone in buona salute.
Ma tra l'altro chi successivamente ha provato i dati dello studio per la riproducibilità erano Baggerly ed i suoi colleghi (Kevin Coombes, Ph.D. e Jeffrey Morris, Ph.D., dal Centro del Cancro del M.D. Anderson e da Sara Edmonson, M.D., dall'Istituto Universitario di Baylor di Medicina). Dicono i centri dell'emissione su come i dati dello spettrometro di massa sono stati analizzati.
Uno spettrometro di massa è uno strumento che può misurare quantitativamente la concentrazione di centinaia di proteine da un singolo campione. In Breve, fa questo mediante usando una corrente elettrica per azionare le proteine ionizzate verso un rivelatore. Il numero degli ioni che colpiscono il rivelatore ad ogni rapporto della massa--tassa (anche conosciuto come il rapporto di m/z) è registrato per produrre uno spettro della proteina. Un picco nel grafico dello spettro rappresenta una proteina (l'identità di cui è spesso sconosciuto).