新しい調査では、研究者は癌のための診断試験を案出するのに proteomics のひな鳥科学を使用するときうまくいかないかもしれないものがについての 「警戒の物語」を示します。
国立癌研究所のジャーナルの 2 月 16 日問題では、 M.D. アンダーソン蟹座の中心テキサス州立大学からの研究者は血の小さいサンプルからの早い卵巣癌を識別するように意図されている実験テストが信頼できる臨床テストにすぐに導いてがまずないなぜか詳しく述べます。
テストの有効性をサポートしたデータの繰り返された小切手を行なった後、研究者は言います実験蛋白質ベースの試金についての要求が生物学的にもっともらしくないことを調査結果が示すことを。
「私達は警戒の物語としてこれを見ます。 ひねりを私達が十分に理解しないこの新技術と注意しなければ」、言います調査の主執筆者、キース Baggerly、 Ph.D。、生物統計学及び応用数学の部門の助教授を生物学以外何かが原因であるかもしれない結果を見つけることができます。
彼は 1 つの実験室からの結果が他確認することができるようにこれらの調査にかかわるプロトコルは実験室を渡って共通べきであること proteomics の研究を行なうため」、意味標準をセットするこの調査が 「研究者のための必要性を説明する付け加えます。
「私達はその方向で移動しています」と彼は付け加えます。 「いろいろ proteomic 診断試験を開発するのに使用される技術よりよくなって、私達は得ていますより再生可能な結果を」。は
世界的の研究者は個々の癌を識別するのに蛋白質 「バーコード」の使用の概念について proteomics のこの出現フィールドの約束はまだずっと蛋白質ことをの複雑で、再生可能なパターンを見つけることの難しさが会われた原因ではないことを徴候が現われるが、 Baggerly および他が主張する前に刺激されます。
Baggerly に従って、それは今最初に提案された、尖頭アーチ問題になった実験卵巣癌テストの場合にはそうジャーナルの研究者によって 2002 年にようです。 その調査は質量分析を使用して血の蛋白質のパターンを捜すために劇的な結果を報告しました。 盲目にされたサンプルの複数のセットでは、テストは卵巣癌を経験した検出し、 3 人の健全な個人だけを誤診しましたすべての患者を。
しかし続いてテストした他の人の中に再現性の調査のデータは Baggerly および彼の同僚 (ケビン Coombes、 Ph.D。、および Jeffrey Morris、 Ph.D。、 M.D. アンダーソンの蟹座の中心およびサラ Edmonson、薬の Baylor の大学からの M.D. からの、) でした。 彼らは質量分析計データがどのようにの分析されたか問題の中心を言います。
質量分析計は量的に何百もの単一のサンプルからの蛋白質の集中を測定できる器械です。 つまり、それは探知器の方にイオン化された蛋白質を推進するのに電流の使用によってこれをします。 各大容量に料金の比率 (別名 m/z の比率) で探知器に当るイオンの番号は蛋白質スペクトルを作り出すために記録されます。 スペクトルのグラフのピークは (識別を頻繁に未知である) 蛋白質表します。