Em um estudo novo, os pesquisadores apresentam “um conto preventivo” sobre o que pode ir mal ao usar a ciência do principiante do proteomics para planejar um teste de diagnóstico para o cancro.
Na introdução do 16 de fevereiro do Jornal do Instituto Nacional para o Cancro, os pesquisadores Do Centro do Cancro da Universidade do Texas M.D. Anderson detalham porque um teste experimental pretendido identificar o cancro do ovário adiantado de uma amostra pequena de sangue é pouco susceptível de conduzir imediatamente a um teste clínico seguro.
Após ter conduzido verificações repetidas dos dados que apoiaram a eficácia do teste, os pesquisadores dizem que seus resultados indicam que as reivindicações sobre o ensaio proteína-baseado experimental não são biològica plausíveis.
“Nós vemos este como um conto preventivo. Se você não é cuidadoso com esta nova tecnologia, cujos caprichos nós não compreendemos inteiramente, você pode encontrar os resultados que podem ser devido a algo a não ser a biologia,” diz o autor principal do estudo, Keith Baggerly, Ph.D., um professor adjunto no Departamento da Bioestatística & Matemática Aplicada.
Adiciona que este estudo “ilustra a necessidade para que os pesquisadores ajustem os padrões por que para conduzir a pesquisa do proteomics,” significado que os protocolos envolvidos nestas investigações devem ser comuns através dos laboratórios de modo que os resultados de um laboratório possam ser verificados por outro.
“Nós estamos movendo-nos nesse sentido,” adiciona. “A tecnologia que está sendo usada para desenvolver uma variedade de testes de diagnóstico proteomic está obtendo melhor e nós estamos obtendo uns resultados mais reprodutíveis.”
Os Pesquisadores no mundo inteiro são entusiasmado sobre a noção de usar a proteína “códigos de barras” para identificar cancros individuais antes que os sintomas apareçam, mas Baggerly e outro mantêm que a promessa deste campo emergente do proteomics não foi ainda encontrado devido à dificuldade em encontrar testes padrões complexos, reprodutíveis das proteínas.
De acordo com Baggerly, aquele parece agora ser o caso com o teste experimental do cancro do ovário na edição, que foi propor primeiramente em 2002 por pesquisadores no jornal, Lanceta. Esse estudo relatou resultados dramáticos usando a espectrometria em massa para procurarar por um teste padrão das proteínas no sangue. Em diversos grupos de amostras cegadas, o teste detectou todos os pacientes que estiveram com o cancro do ovário e diagnosticams mal somente três indivíduos saudáveis.
Mas entre outros quem testou subseqüentemente os dados do estudo para a reprodutibilidade eram Baggerly e seus colegas (Kevin Coombes, Ph.D., e Jeffrey Morris, Ph.D., do Centro do Cancro do M.D. Anderson, e da Sarah Edmonson, M.D., da Faculdade de Baylor da Medicina). Dizem os centros da edição em como os dados do espectrómetro em massa foram analisados.
Um espectrómetro em massa é um instrumento que possa quantitativa medir a concentração de centenas de proteínas de uma única amostra. Em curto, faz este usando uma corrente elétrica para propelir proteínas ionizadas para um detector. O número de íons que batem o detector em cada relação da massa-à-carga (igualmente conhecida como a relação de m/z) é gravado para produzir um espectro da proteína. Um pico no gráfico do espectro representa uma proteína (a identidade de que é frequentemente desconhecido).