В новом изучении, исследователя представляют «предостерегающий сказ» о что может пойти неправильно при использовании науки зелёного юнца proteomics для того чтобы изобрести диагностический тест для рака.
В вопросе 16-ое февраля Журнала Национального Института Раковых Заболеваний, исследователя от Центра Карциномы D. Андерсона Техасского Университета M. детализируют почему экспириментально испытание предназначенное определить предыдущий овариальный рак от малого образца крови маловероятно для ведения к надежному клиническому праву испытания - прочь.
После дирижировать повторенные проверки данных которые поддержали эффективность испытания, исследователя говорят что их заключения показывают что заявки о экспириментально протеин-основанном assay биологически не правдоподобны.
«Мы осматриваем это как предостерегающий сказ. Если вы не тщательны с этой новой технологией, то особенности которой мы полно не понимаем, вы можете найти результаты которые могут быть должны к что-то за исключением биологии,» говорите ведущего автор изучения, Кейт Baggerly, Ph.D., адъюнкта-профессора в Отделе Биостатистики & Прикладную Математику.
Он добавляет что это изучение «иллюстрирует потребность для исследователей установить стандарты которыми дирижировать исследование proteomics,» смысль что протоколы, котор включили в эти исследования должны быть общими через лаборатории так, что результаты от одной лаборатории смогут быть подтвержены другими.
«Мы двигаем в то направление,» он добавляет. «Технология будучи использованной для того чтобы начать разнообразие proteomic диагностические тесты получает более лучшей и мы получаем более возпроизводимые результаты.»
Исследователя всемирно возбуждены о придумке использования протеина «штрихкодов» для того чтобы определить индивидуальные раки прежде чем симптомы появляются, но Baggerly и другие поддерживают что посыл этого вытекая поля proteomics пока встрещенные должные к затруднению в находить сложные, возпроизводимые картины протеинов.
Согласно Baggerly, то теперь кажется, что будет случаем с экспириментально испытанием овариального рака на вопросе, который сперва был предложен в 2002 исследователями в журнале, Ланцет. То изучение сообщило драматические результаты используя массовое спектрометрирование для того чтобы искать для картины протеинов в крови. В нескольких комплектов ослепленных образцов, испытание обнаружило всех пациентов которые имели овариальный рак и только misdiagnosed 3 здоровых индивидуала.
Но среди других которые затем испытали данные по изучения для воспроизводимости были Baggerly и его коллегаами (Кевином Coombes, Ph.D., и Джеффри Моррисом, Ph.D., от Центра Карциномы D. Андерсона M., и Сары Edmonson, M.D., от Коллежа Baylor Медицины). Они говорят центры вопроса на как данные по массового спектрометра были проанализированы.
Массовый спектрометр аппаратура которая может количественно измерить концентрацию сотни протеинов от однократной выборки. Вкратце, он делает это путем использование электрического тока для того чтобы стимулировать ионизированные протеины к детектору. Записаны, что производит число ионов ударяя детектор на каждом коэффициенте масс-к-обязанности (также известном как коэффициент m/z) спектр протеина. Пик в диаграмме спектра представляет протеин (тождественность чего часто неизвестен).