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关于这个实验含蛋白质的检验的索赔不是生物振振有词的

Published on February 15, 2005 at 5:22 PM · No Comments

在新的研究中,研究员存在 “警告传说”关于什么可以出错,当使用 proteomics 雏鸟科学构想癌症的时诊断测试。

在国家癌症学会日记帐的 2月 16日问题,从得克萨斯大学的研究员 M.D. 安徒生巨蟹星座中心详述打算的一个实验测试识别从血液一个小的范例的早期的卵巢癌为什么是不太可能立即导致一个可靠的临床测试。

在进行支持测试的效果数据的被重复的检查以后,研究员说他们的发现表明关于这个实验含蛋白质的检验的索赔不是生物振振有词的。

“我们查看此作为一个警告传说。 如果您对此新技术不小心,突变我们不充分地了解,您能找到可能归结于某事除生物之外的结果”,说研究的主要作者、基思 Baggerly, Ph.D。,生物统计学 & 应用数学的部门的一位副教授。

他补充说,此研究 “说明需要对于研究员规定开展 proteomics 研究”,含义的标准根据在这些调查介入的协议应该是公用的在实验室间,以便从一个实验室的结果可以由其他验证。

“我们朝该方向行动”,他补充说。 “使用的技术开发各种各样的 proteomic 诊断测试变得更好,并且我们取得更加再现的结果”。

全世界研究员被激发关于使用蛋白质的饰物 “条形码”识别各自的癌症,在症状出现前,但是 Baggerly 和其他主张 proteomics 的此涌现的域承诺未满足的归结于在查找蛋白质的复杂,再现模式的困难。

根据 Baggerly,那现在看来是与争论中实验卵巢癌的测试 的实际情形在 2002年在这个日记帐上首先建议由研究员,柳叶刀。 该研究报告显著成果使用质谱分析搜索蛋白质的模式在血液的。 在几套盲目的范例,这个测试检测了有卵巢癌的所有患者和只误诊了三个健康单个。

但是除了别的以外谁随后测试了研究的数据为增殖率是 Baggerly 和他的同事 (凯文 Coombes、 Ph.D。和杰费莫妮斯, Ph.D。,从 M.D. 安徒生巨蟹星座中心和萨拉 Edmonson, M.D.,从医学 Baylor 学院)。 他们说关于怎样的问题中心分析了质谱仪数据。

一台质谱仪是可能定量地评定数百浓度从一个唯一范例的蛋白质的仪器。 简而言之,它执行此通过使用电流推进被电离的蛋白质往探测器。 击中这台探测器的离子的数量在每个质量对充电比例 (亦称 m/z 比例) 被记录导致蛋白质光谱。 在这个光谱的图形的一个峰顶表示经常是未知的) 的蛋白质 (身分的。

这个目标是查找将区分在有癌症的病人之间是癌症自由峰顶和那些人的模式。 柳叶刀研究的作者报告了在三分离数据集的不同的 proteomic 模式。 纽约,石溪州立大学的研究员,重新分析数据寻找再现模式。 在 2003年,他们报告了查找一个唯一模式介入可能诊断在二的卵巢癌这些数据集间的 18 个峰顶 (或未认出的蛋白质)。

M.D. 安徒生研究员检查数据集的质量并且认为,此系统的蛋白质模式 “是生物难以置信的”。 Baggerly 解释差别对待的峰顶看上去在第二数据集的整个 m/z 光谱间分布,但是 “在蛋白质表达式上的变化与癌症相关应该影响仅一些个特定峰顶,不是整个光谱”。

此外,研究员说某些蛋白质峰顶在质谱分析不,因技术上的原因,抽样蛋白质和可能因而表示实验 “噪声光谱的地区被找到”。 这样结果可能来自这样程序问题象范例的未完成随机化, Baggerly 说。

这个研究提出比实验卵巢癌测试的效果清楚的问题,研究员说。 “是我们去能评定什么我们要评定?” Baggerly 要求。 “特定问题在技术和缺乏标准,我认为它将是几年,在我们可以知道前什么运作”。

http://www.mdanderson.org/