I en ny studie framlägger forskare ”en cautionary saga” om vad kan gå orätt, när det använder nybörjarevetenskapen av proteomicsen för att planera en diagnostik testar för cancer.
I Februari 16 utfärda av Föra Journal över av MedborgareCancerInstitutet, forskare från Cancern Center för Texasuniversitetet M.D. Anderson specificerar därför ett experimentellt testar påtänkt identifiera tidig sort som ovarian cancer från ett litet tar prov av blod är osannolik att leda till ett pålitligt kliniskt testar rätt - bort.
Når att ha förat upprepade kontroller av datan, som stöttade provets effektivitet, forskarenågot att säga som deras rön indikerar, att som fordrar om den experimentella protein-baserade analysen, var inte biologically sannolik.
”Beskådar Vi denna som en cautionary saga. Om du inte är försiktig med denna ny teknik, vars quirks vi inte förstår fullständigt, kan du finna resultat, som kan vara tack vare något annat än biologi,” något att säga studie bly- författare, Keith Baggerly, Ph.D., en förbunden professor i Avdelningen av Biostatistics & Applicerad Matematik.
Han tillfogar att denna studie ”illustrerar behovet för forskare till fastställda normal vid som att föra proteomicsforskning,” menande, som protokoll som är involverade i dessa utredningar, bör vara vanligt över laboratorium, så att resultat från ett labb kan verifieras av andra.
”Är Vi inflyttningen som riktningen,”, tillfogar han. ”Teknologin som framkallar den är van vid, en variation av proteomic diagnostik testar får bättre, och vi får mer reproducible resultat.”,
Forskare är över hela världen upphetsada om aningen av att använda protein ”barcodes” för att identifiera individcancer, för tecken visas, men Baggerly och andra underhåller att löftet av detta som dyker upp sätter in av proteomics ännu inte har mötts tack vare svårigheten, i att finna komplex som är reproducible mönstrar av proteiner.
Enligt Baggerly verkar det nu att vara fallet med den experimentella ovarian cancern testar på utfärdar, som var först föreslagen i 2002 av forskare i föra journal över, Lanceten. Det studien anmälde använda för dramatiska resultat samlas spectrometry för att söka för en mönstra av proteiner i blod. I flera uppsättningar av bländat tar prov, avkände misdiagnosed testa alla tålmodig, som hade ovarian cancer, och endast tre sunda individer.
Men bland andra, som testade därpå, studie var data för reproducibility Baggerly och hans kollegor (Kevin Coombes, Ph.D. och Jeffrey Morris, Ph.D., från Cancer för M.D. Anderson Centrerar, och Sarah Edmonson, M.D., från den Baylor Högskolan av Medicinen). Dem något att säga som utfärda centrerar på hur samlasspectrometerdatan analyserades.
En samlasspectrometer är en instrumentera som kan quantitatively mäta koncentrationen av hundratals proteiner från en singel tar prov. I kort stavelse gör den denna, genom att använda en elektrisk ström för att framdriva joniserade proteiner in mot en avkännare. Numrera av joner som slår avkännaren på varje samlas-till-laddningen förhållande (också som är bekant som m-/zförhållande) antecknas till jordbruksprodukter en proteinspectrum. Ett maximalt i grafen av spectrumen föreställer ett protein (identiteten av som är ofta okänt).