關於這個實驗含蛋白質的檢驗的索賠不是生物振振有詞的

在新的研究中，研究員存在 「警告傳說」關於什麼可以出錯，當使用 proteomics 雛鳥科學構想癌症的時診斷測試。

在國家癌症學會日記帳的 2月 16日問題，從得克薩斯大學的研究員 M.D. 安徒生巨蟹星座中心詳述打算的一個實驗測試識別從血液一個小的範例的早期的卵巢癌為什麼是不太可能立即導致一個可靠的臨床測試。

在進行支持測試的效果數據的被重複的檢查以後，研究員說他們的發現表明關於這個實驗含蛋白質的檢驗的索賠不是生物振振有詞的。

「我們查看此作為一個警告傳說。 如果您對此新技術不小心，突變我們不充分地瞭解，您能找到可能歸結於某事除生物之外的結果」，說研究的主要作者、基思 Baggerly， Ph.D。，生物統計學 & 應用數學的部門的一位副教授。

他補充說，此研究 「說明需要對於研究員規定開展 proteomics 研究」，含義的標準根據在這些調查介入的協議應該是公用的在實驗室間，以便從一個實驗室的結果可以由其他驗證。

「我們朝該方向行動」，他補充說。 「使用的技術開發各種各樣的 proteomic 診斷測試變得更好，并且我們取得更加再現的結果」。

全世界研究員被激發關於使用蛋白質的飾物 「條形碼」識別各自的癌症，在症狀出現前，但是 Baggerly 和其他主張 proteomics 的此湧現的域承諾未滿足的歸結於在查找蛋白質的複雜，再現模式的困難。

根據 Baggerly，那現在看來是與爭論中實驗卵巢癌的測試 的實際情形在 2002年在這個日記帳上首先建議由研究員，柳葉刀。 該研究報告顯著成果使用質譜分析搜索蛋白質的模式在血液的。 在幾套盲目的範例，這個測試檢測了有卵巢癌的所有患者和只誤診了三個健康單個。

但是除了別的以外誰隨後測試了研究的數據為增殖率是 Baggerly 和他的同事 (凱文 Coombes、 Ph.D。和傑費莫妮斯， Ph.D。，從 M.D. 安徒生巨蟹星座中心和薩拉 Edmonson， M.D.，從醫學 Baylor 學院)。 他們說關於怎樣的問題中心分析了質譜儀數據。

一臺質譜儀是可能定量地評定數百濃度從一個唯一範例的蛋白質的儀器。 簡而言之，它執行此通過使用電流推進被電離的蛋白質往探測器。 擊中這臺探測器的離子的數量在每個質量對充電比例 (亦稱 m/z 比例) 被記錄導致蛋白質光譜。 在這個光譜的圖形的一個峰頂表示經常是未知的) 的蛋白質 (身分的。

這個目標是查找將區分在有癌症的病人之間是癌症自由峰頂和那些人的模式。 柳葉刀研究的作者報告了在三分離數據集的不同的 proteomic 模式。 紐約，石溪州立大學的研究員，重新分析數據尋找再現模式。 在 2003年，他們報告了查找一個唯一模式介入可能診斷在二的卵巢癌這些數據集間的 18 個峰頂 (或未認出的蛋白質)。

M.D. 安徒生研究員檢查數據集的質量并且認為，此系統的蛋白質模式 「是生物難以置信的」。 Baggerly 解釋差別對待的峰頂看上去在第二數據集的整個 m/z 光譜間分佈，但是 「在蛋白質表達式上的變化與癌症相關應該影響仅一些個特定峰頂，不是整個光譜」。

此外，研究員說某些蛋白質峰頂在質譜分析不，因技術上的原因，抽樣蛋白質和可能因而表示實驗 「噪聲光譜的地區被找到」。 這樣結果可能來自這樣程序問題像範例的未完成隨機化， Baggerly 說。

這個研究提出比實驗卵巢癌測試的效果清楚的問題，研究員說。 「是我們去能評定什麼我們要評定？」 Baggerly 要求。 「特定問題在技術和缺乏標準，我認為它將是幾年，在我們可以知道前什麼運作」。

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