Génome indices d'dysenterie amibienne

Published on March 1, 2005 at 8:29 AM · No Comments

Chaque année, il ya environ 50 millions de cas de dysenterie amibienne, provoquant jusqu'à 100.000 morts, essentiellement dans les pays en développement. Le jeudi 24 Février 2005, des chercheurs de l' institut Wellcome Trust Sanger et leurs collègues ont rapporté dans la revue Nature la séquence du génome du parasite qui cause la maladie, Entamoeba histolytica.

Chaque année, il ya environ 50 millions de cas de dysenterie amibienne, provoquant jusqu'à 100.000 morts, essentiellement dans les pays en développement. Le jeudi 24 Février 2005, des chercheurs de l'institut Wellcome Trust Sanger et leurs collègues ont rapporté dans la revue Nature la séquence du génome du parasite qui cause la maladie, Entamoeba histolytica.

Une image saisissante nouvelle émerge d'un organisme s'adapte à la vie comme un parasite de l'intestin humain. Il semble avoir largué nombreux gènes nécessaires à la survie indépendante, comptant plutôt sur nous, son hôte humain, pour l'aider à sortir. Dans le même temps, elle semble avoir repris les gènes de la bactérie dans son environnement - les gènes qui lui permettent d'utiliser une large gamme de sucres et autres sources d'énergie.

Dr Matt Berriman, chef de projet au Wellcome Trust Sanger Institute, déclare: «Les résultats donnent un aperçu fascinant de la façon dont ce parasite ancienne évolué et met en lumière les processus métaboliques inhabituelle qui pourrait être exploitable en tant que cibles des médicaments. Le génome est plein d'enzymes et de transporteurs qui pourrait être suivie par l'expérimentation. "

E. histolytica est un organisme remarquable. Son nom provient du fait qu'il «mange» les tissus (histo-, tissus; lyse, desserrer): il a aussi un appétit vorace pour les bactéries, ce qui est de savoir comment elle peut être cultivée dans des tubes à essai. La dysenterie amibienne est pris en ingérant des kystes - organismes en sommeil - de l'eau, la nourriture ou des mains contaminées par des fèces humaines. A l'intérieur de l'intestin de l'hôte humain, le parasite et trappes commencent à se multiplier.

Le séquençage de E. histolytica a été un effort de collaboration mené par le Wellcome Trust Sanger Institute et The Institute for Genomic Research (TIGR) à Rockville, MD, Etats-Unis. Le projet a été soutenu par des subventions du Wellcome Trust et de l'Institut national des allergies et maladies infectieuses (NIAID), qui fait partie de la National Institutes of Health.

La séquence révèle près de 10.000 gènes, dont certains semblent avoir été acquis par des bactéries. Près d'un tiers des gènes ne sont pas liés à des gènes dans les bases de données publiques.

"Entamoeba histolytica est une cause majeure de diarrhée aiguë dans les pays en développement, mais la communauté des chercheurs travaillant pour le combattre est relativement faible", a poursuivi le Dr Berriman. "La séquence projet prévoit un coup de pouce bien nécessaire, et nos efforts continus pour améliorer notre compréhension permettra de renforcer ces efforts."

Un trait caractéristique de E. histolytica est son appétit vorace - il vit dans un environnement où il est entouré par les bactéries et les mange. Dans l'intestin humain, elle provoque la perte de la diarrhée, du liquide et du sel et des saignements du tube digestif. Il peut aussi envahir la paroi intestinale et la propagation à d'autres tissus, entraînant des maladies plus graves.

«De toute évidence, cette amibe possède des gènes qui lui permettent de détecter certaines facettes de son environnement et réagir à ces signaux", a déclaré Neil Hall, un scientifique de l'institut Sanger, maintenant au TIGR, qui est l'auteur principal de l'étude de la nature.

Il a été longtemps considéré comme un «primitif» l'organisme - en provenance de l'époque que les bactéries et les organismes plus complexes ont divergé dans l'évolution, car il manque de nombreux éléments caractéristiques des cellules plus complexes. Il a aussi quelques traits typiques de bactéries.

Un tableau qui se dessine et le renforcement de la séquence des génomes du parasite est le nombre de gènes que les organismes utilisent avec succès pour échapper à nos mécanismes de défense. E. histolytica possède de grandes «familles» de gènes utilisés pour produire sa couche de surface. On pense qu'il peut utiliser différentes couches pour empêcher la détection dans le corps humain pendant des années à la fois.

La gamme de tours génétique surpris l'équipe de recherche, mais conduit aussi à l'espoir. "Il est également inhabituel pour beaucoup de bactéries ressemblant à des gènes d'être utilisé de cette façon", a commenté le Dr Berriman. «Prises ensemble, ces résultats ouvrent de nombreuses possibilités pour la production d'inhibiteurs sélectifs -. Médicaments qui affectent l'organisme, mais ne nous touchent pas"

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