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Analisi sperimentali genoma di ampiezza più complete delle trascrizioni senso-antisenso fin qui

Published on March 15, 2005 at 12:46 PM · No Comments

Un gruppo degli scienziati piombo dal Dott. Kuniya Abe dal Centro di RIKEN BioResource nel Giappone ha eseguito una delle analisi sperimentali genoma di ampiezza più complete delle trascrizioni senso-antisenso fin qui. I Loro risultati sono pubblicati nell'emissione di Aprile della Ricerca del Genoma del giornale.

le trascrizioni Senso-Antisenso, o SATs, sono paia delle molecole del RNA generate dai fili opposti del DNA allo stesso luogo. Il numero di SATs ha identificato negli ultimi anni si è sviluppato sostanzialmente ed ora sono credute per comprendere almeno 8% i geni umani. Molte paia di SAT sono state implicate in varie fasi del regolamento del gene, compreso trascrizione, trattamento del mRNA, l'impionbatura, la stabilità, il trasporto e la traduzione. I Vari esempi di tali geni di sovrapposizione sono stati documentati in tutte le forme di vita - dai virus e dai prokaryotes alle piante ed agli animali.

Fin qui, la maggior parte dei studi sulle paia di SAT hanno utilizzato puramente in silico gli approcci; molto pochi hanno convalidato sperimentalmente l'esistenza delle molecole di sovrapposizione del RNA in vivo. A tal fine, Dott. Hidenori Kiyosawa, l'autore principale sul documento, precisato per confermare la presenza di SATs in vari tipi e colture cellulari del tessuto del mouse come pure per identificare le caratteristiche comuni di queste trascrizioni uniche.

Impiegando un chip su ordine di microarray ha progettato per individuare un'espressione filo-specifica delle paia 1947 di SAT, i ricercatori hanno scoperto che la maggior parte del SATs ampiamente sono stati espressi in cervello, cuore e testicolo del mouse come pure nelle cellule staminali e nei fibroblasti embrionali del mouse. Mentre un certo SATs è stato espresso ad un livello coerente in tutti i celle e tessuti provati, altri profondi reticoli tessuto-specifici esibiti di espressione.