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As análises experimentais genoma-largas as mais detalhadas de transcritos sentido-antisentido até agora

Published on March 15, 2005 at 12:46 PM · No Comments

Uma equipe dos cientistas conduzidos pelo Dr. Kuniya Abe do Centro de RIKEN BioResource em Japão executou uma das análises experimentais genoma-largas as mais detalhadas de transcritos sentido-antisentido até agora. Seus resultados são publicados na introdução de Abril da Pesquisa do Genoma do jornal.

os transcritos Sentido-Antisentido, ou SATs, são pares de moléculas do RNA geradas das costas opostas do ADN no mesmo locus. O número de SATs identificou nos os últimos anos cresceu substancialmente, e são acreditados agora para compreender pelo menos 8% de genes humanos. Muitos pares do SAT foram implicados nas várias fases do regulamento do gene, incluindo a transcrição, o processamento do mRNA, a emenda, a estabilidade, o transporte, e a tradução. Os Vários exemplos de tais genes de sobreposição foram documentados em todos os formulários de vida - dos vírus e dos prokaryotes aos vegetais e animal.

Até agora, a maioria de estudos em pares do SAT utilizaram puramente in silico aproximações; muito poucos validaram experimental a existência de moléculas de sobreposição do RNA in vivo. Com isto em mente, Dr. Hidenori Kiyosawa, autor principal no papel, expor para confirmar a presença de SATs em uma variedade de tipos e culturas celulares do tecido do rato, assim como para identificar características comuns destes transcritos originais.

Empregando uma microplaqueta feito-à-medida do microarray projectou detectar uma expressão costa-específica dos pares 1947 do SAT, os pesquisadores descobriram que a maioria do SATs estiveram expressados extensamente no cérebro, no coração, e no testículo do rato, assim como em células estaminais e em fibroblasto embrionários do rato. Quando algum SATs foi expressado a nível consistente em todas as pilhas e tecidos testados, outro testes padrões tecido-específicos marcados exibidos da expressão.