Para peneliti di Baylor College of Medicine (BCM) dan Rice University telah mengembangkan sebuah "buta warna" metode deteksi fluoresensi yang bisa membuka pintu baru yang akan mengambil DNA sekuensing ke samping tempat tidur pasien, kantor dokter dan bahkan TKP atau medan perang.
Dr Michael L. Metzker, asisten profesor di Genome Sequencing BCM Manusia Pusat dan asisten asisten profesor kimia di Rice, mengatakan teknik ini akhirnya bisa memungkinkan deteksi langsung dari urutan DNA dari DNA asli tanpa manipulasi kompleks saat ini dilakukan di laboratorium, itu akan membuat sekuensing portabel dan lebih cepat.
Dalam makalah penelitian, Metzker, Rice University Profesor Robert Curl dan rekan dari BCM dan Rice menjelaskan cara baru dalam melakukan sekuensing DNA yang bisa lebih akurat daripada metode saat ini. Makalah ini muncul minggu ini dalam jurnal Prosiding National Academy of Sciences .
DNA di dalam inti setiap sel manusia terbuat dari rantai panjang blok bangunan yang disebut nukleotida, DNA sekuensing 'mengacu pada proses ilmuwan menggunakan untuk membaca urutan nukleotida tersebut. Hal ini terdiri dari empat jenis nukleotida - A, C, G dan T - dan diselenggarakan sehingga A T dan G mengikat mengikat C, membentuk struktur heliks ganda. Genom setiap orang terdiri dari pemesanan yang unik dari beberapa 3 miliar pasangan basa.
Dalam sekuensing, para ilmuwan mengekstrak DNA dari inti sel dan melalui serangkaian telaten kloning bakteri dan / atau polymerase chain reaction (PCR) langkah, mengurangi panjang untuk ukuran dikelola ribuan nukleotida.
Kemudian dengan menggunakan enzim replikasi alami, DNA ditandai dengan empat pewarna neon, masing-masing sesuai dengan nukleotida tertentu. Proses penandaan, sekuensing Sanger disebut, menghasilkan fragmen DNA yang lebih kecil, yang kemudian dipisahkan oleh basis-basis. Karena fragmen DNA ditandai dengan pewarna, mereka bersinar ketika mereka dipukul oleh sinar laser yang membantu untuk menentukan urutan dari urutan DNA.
Sequencing hari ini biasanya dilakukan dengan satu laser dan optik untuk memisahkan pewarna ke dalam empat warna, biru, hijau, kuning, dan merah, dan masalah dengan teknik ini adalah bahwa warna cahaya yang dipancarkan oleh pewarna terlalu mirip. Program komputer yang rumit membantu untuk menguraikan sinyal, tapi cross-talk, variasi halus antara pewarna, dapat menyebabkan nukleotida menjadi miscalled.
Metode baru yang dikembangkan di BCM dan Rice, yang disebut eksitasi multiline berdenyut (PME), menghilangkan masalah ini dengan menggunakan empat laser, masing-masing cocok dengan pewarna tertentu dan memungkinkan peneliti untuk mengambil keuntungan dari spektrum terlihat seluruh.