在约翰斯・奥普金斯的基因猎人通过修改这个基因的管理区域发现了增加继承特殊先天缺陷的风险不由打乱基因的蛋白质做指令通常途径的公用基因变化,但是。 虽然这个情况,称 Hirschsprung 疾病,是少见的,其复杂遗传学仿造物常见病,例如糖尿病和心脏病。
“它是一个滑稽的变化在一个滑稽的安排”,领导人 Aravinda Chakravarti, Ph.D 说研究。,基因医学 McKusick-Nathans 学院的院长。 “但是我认为在主要疾病找到的大部分变化在滑稽的安排是滑稽的变化”。
远离是问题,查找是好消息,他建议。 “在蛋白质编码顺序的变化不可能确实是固定,然而那些在蛋白质编码地区之外 -- 或许我们可以乱动他们,或许他们是 ‘可调的’。 蛋白质应该是细致的,如果我们可以获得细胞做正确的金额”,他说。
“我们查找确实强调这个情况健康和疾病可以受基因的所有地区影响”,他继续。 “为疾病请喜欢糖尿病,并且心脏病,正 Hirschsprung 疾病的,多个被继承的系数造成这个疾病,并且这些系数仅仅不在蛋白质编码地区”。
或许研究员的发现,描述在本质的 4月 14日问题,添加到由基因的指令蛋白质做的相当数量的问题可能是正重要的象的生长证据 - 和重要比 -- 在蛋白质上的变化,他们说。
“但是查找重要变化在蛋白质编码顺序外面是挑战由于通过排序的相当数量基因”,附注博士后 Eileen Emison, Ph.D。,研究的第一个作者。 “仅 1.5% 的在我们的基因的大致 30亿构件运载蛋白质的指令”。
幸运地,关于那两次经受了时间和演变测试并且保持同样或者非常类似,在多种种类中,指示地区的生物重要性。 通过比较人和其他种类基因顺序查找这些地区,然后结合那些结果与疾病的传统基因研究在系列的,疾病关连的变化的搜索在所谓的非编码顺序可以是成功的,研究员显示。
实际上,研究员使用此联合的途径发现在 RET 基因的风险增加的变化在单个以 Hirschsprung 疾病。 在此先天缺陷,多个基因变化的作用 -- 许多寂静的未知 -- 结合防止控制小肠功能神经的适当的发展。 仅 30% 的 Hirschsprung 盒附加对一个特定蛋白质更改的变化,即使八个基因的蛋白质编码地区在这个疾病已经知道介入。
新的风险确认的变化确认 Chakravarti 的长期持有的怀疑一些 Hirschsprung 的未知在非编码地区也许归结于变化,在疾病关连的变化的搜索通常没有包括。 基因的非编码地区 -- 在哪些附近不必须甚至在基因的蛋白质编码顺序附近 -- 包含基因的在切换 (促进者),是否调整的区,这个基因何时并且怎样用于做仍然似乎是补白的蛋白质 (改进物或抑制器) 和其他浩瀚。 新的变化在称 RET 的基因,蛋白质编码顺序已经附加对这个疾病。
要寻找 Hirschsprung 关连的变化在主要未知的非编码地区, Chakravarti 和他的合作首先确定了 28 特定基因构件的身分或者标记,在包围在范例的一个大区域 RET 基因从 126 个人以 Hirschsprung 疾病和他们的父项。 (更加早期的工作附加在这些系列的疾病对包括 RET 的一个大区域,但是蛋白质更改的变化在受影响的单个未被找到。)
基因标记的身分作为研究员能跟踪的一种签名。 计算机分析识别脱氧核糖核酸,一的三个大地区包括 RET 基因,从父项比一个人单独将偶然预计经常通过给受影响的子项 (但是不未受影响的子项)。 在 RET 附近的一个特殊八标记签名紧密地与这个疾病,研究员相关找到。