在約翰斯・奧普金斯的基因獵人通過修改這個基因的管理區域發現了增加繼承特殊先天缺陷的風險不由打亂基因的蛋白質做指令通常途徑的公用基因變化,但是。 雖然這個情況,稱 Hirschsprung 疾病,是少見的,其複雜遺傳學仿造物常見病,例如糖尿病和心臟病。
「它是一個滑稽的變化在一個滑稽的安排」,領導人 Aravinda Chakravarti, Ph.D 說研究。,基因醫學 McKusick-Nathans 學院的院長。 「但是我認為在主要疾病找到的大部分變化在滑稽的安排是滑稽的變化」。
遠離是問題,查找是好消息,他建議。 「在蛋白質編碼順序的變化不可能確實是固定,然而那些在蛋白質編碼地區之外 -- 或許我們可以亂動他們,或許他們是 『可調的』。 蛋白質應該是細致的,如果我們可以獲得細胞做正確的金額」,他說。
「我們查找確實強調這個情況健康和疾病可以受基因的所有地區影響」,他繼續。 「為疾病请喜歡糖尿病,并且心臟病,正 Hirschsprung 疾病的,多個被繼承的系數造成這個疾病,并且這些系數僅僅不在蛋白質編碼地區」。
或許研究員的發現,描述在本質的 4月 14日問題,添加到由基因的指令蛋白質做的相當數量的問題可能是正重要的像的生長證據 - 和重要比 -- 在蛋白質上的變化,他們說。
「但是查找重要變化在蛋白質編碼順序外面是挑戰由於通過排序的相當數量基因」,附註博士後 Eileen Emison, Ph.D。,研究的第一個作者。 「仅 1.5% 的在我們的基因的大致 30億構件運載蛋白質的指令」。
幸運地,關於那兩次經受了時間和演變測試并且保持同樣或者非常類似,在多種種類中,指示地區的生物重要性。 通過比較人和其他種類基因順序查找這些地區,然後結合那些結果與疾病的傳統基因研究在系列的,疾病關連的變化的搜索在所謂的非編碼順序可以是成功的,研究員顯示。
實際上,研究員使用此聯合的途徑發現在 RET 基因的風險增加的變化在單個以 Hirschsprung 疾病。 在此先天缺陷,多個基因變化的作用 -- 許多寂靜的未知 -- 結合防止控制小腸功能神經的適當的發展。 仅 30% 的 Hirschsprung 盒附加對一個特定蛋白質更改的變化,即使八個基因的蛋白質編碼地區在這個疾病已經知道介入。
新的風險確認的變化確認 Chakravarti 的長期持有的懷疑一些 Hirschsprung 的未知在非編碼地區也許歸結於變化,在疾病關連的變化的搜索通常沒有包括。 基因的非編碼地區 -- 在哪些附近不必須甚至在基因的蛋白質編碼順序附近 -- 包含基因的在切換 (促進者),是否調整的區,這個基因何時並且怎樣用於做仍然似乎是補白的蛋白質 (改進物或抑制器) 和其他浩瀚。 新的變化在稱 RET 的基因,蛋白質編碼順序已經附加對這個疾病。
要尋找 Hirschsprung 關連的變化在主要未知的非編碼地區, Chakravarti 和他的合作首先確定了 28 特定基因構件的身分或者標記,在包圍在範例的一個大區域 RET 基因從 126 個人以 Hirschsprung 疾病和他們的父項。 (更加早期的工作附加在這些系列的疾病對包括 RET 的一個大區域,但是蛋白質更改的變化在受影響的單個未被找到。)
基因標記的身分作為研究員能跟蹤的一種簽名。 計算機分析識別脫氧核糖核酸,一的三個大地區包括 RET 基因,從父項比一個人單獨將偶然預計經常通過给受影響的子項 (但是不未受影響的子項)。 在 RET 附近的一個特殊八標記簽名緊密地與這個疾病,研究員相關找到。