Verglichen mit einem lang-verwendeten linearen Baumuster, ist eine Wechselbeziehung-basierte statistische Methode eine zuverlässigere Methode, komplexe Geninteraktionen und Genauigkeitsgene, die möglicherweise mögliche Krebsbehandlungsziele sind, entsprechend neuer Brown University-Forschung abzubilden.
Die Forschung ist wichtig, weil sie ein viel versprechendes neues Hilfsmittel für die Spur von menschlichen Genanschlüssen, ein taskabhängiges für das Verständnis und die Behandlung von Krebs und von anderen Krankheiten beschreibt. Ergebnisse erschienen diese Woche in der Onlineausgabe der Verfahren der National Academy Of Sciences.
„Gene beeinflussen sich auf viele verwickelten Arten,“ sagte Leon-Fassbinder, Professor von Physik und von Neurologie und Direktor des Instituts für Gehirn und der Neuralen Anlagen bei Brown. „Was wir brauchen, eine Karte oder Netz, dieser Links ist. Was wir in diesem Projekt gekennzeichnet haben, ist eine effektivere Methode für die Herstellung dieser Karte.“
Das Forschungsteam - das enthaltene Wissenschaftler von den Bereichen der Biologie, der Physik, der Statistiken und der Informatik bei Brown, Università di Bologna in Italien und der Tel Aviv-Universität in Israel - dargelegt, um eine Frage zu beantworten. Wann ein tödliches „oncoprotein“ wird, welche Kettenreaktion der Genaktivität es auslöst angeschaltet?
Das Protein, c-Myc, veranlaßt Zellen zu multiplizieren. Wenn das Protein produziertes unkontrolliertes ist, kann es Brust, Doppelpunkt und andere Baumuster Krebs verursachen. C-Myc trägt zu mehr als 70.000 Todesfällen in den Vereinigten Staaten jedes Jahr bei.
Sobald der c-Myc Schalter geworfen wird, fangen Tausenden anderer Gene, Proteine heraus zu pumpen an oder andere Gene anzuschalten, der noch mehr Gene aktiviert. Eine Möglichkeit, dieses Selennetz von Anschlüssen zu studieren würde, die Kettenreaktion auszulösen und sie im Laufe der Zeit zu studieren sein. Um zu machen das geschehen, fanden Brown-Forscher ein kluges Experiment.
John Sedivy, ein langfristiger c-Myc Forscher und der Direktor von Browns Mitte für Genomics und Proteomics, entwickelte Rattenzellen, die das c-Myc Gen ermangelten. Diese Zellen wurden weiter geändert, um ein Formular vom c-Myc Protein zu machen, das durch den Hormonbehandlung Tamoxifen geschaltetes AN/AUS sein könnte.
Ein Stapel von Zellen wurde mit Tamoxifen behandelt, dann eine, zwei, vier, acht und 16 Stunden später erntete. Ein Anderer Stapel von Zellen erhielt nicht, die Droge aber war geerntetes zur gleichen Zeit Feld.
Die Analyse der Genaktivität erzeugt in den Experimenten deckte 1.191 mögliche Spieler im c-Myc Gennetz auf. Ein statistisches Team, geführt von Gastone Castellani, ein Mitarbeiterforschungsprofessor mit dem Institut für Gehirn und Neurale Anlagen und einem Professor bei Università di Bologna, geprüft zwei Methoden zu versuchen, dieses Netz zu formen.
Eins war das lineare Markov Baumuster, ein Jahrzehnte altes Hilfsmittel, das verwendet wurde, um alles von Sportstatistiken zu Sprachproduktion zu knirschen. Die andere war eine Wechselbeziehungsmethode, die auf Netztheorie basierte, die verwendet worden ist, um komplexe Systeme wie Stromnetze und neurale Netze zu erklären.