Rispetto ad un modello lineare a lungo usato, ad un metodo statistico basato a correlazione è un modo più affidabile mappare le interazioni complesse del gene ed i geni puntuali che possono essere obiettivi potenziali di trattamento del cancro, secondo la nuova ricerca di Brown University.
La ricerca è importante perché descrive un nuovo strumento di promessa per il rintracciamento delle connessioni umane del gene, un compito critico per la comprensione ed il trattamento il cancro e delle altre malattie. I Risultati sono comparso questa settimana nell'edizione online degli Atti dell'Accademia Nazionale delle Scienze.
“I Geni influenzano uno un altro in molti modi complessi,„ ha detto Leon Cooper, il professor di fisica e della neuroscienza e Direttore dell'Istituto per il Cervello e dei Sistemi Neurali a Brown. “Che Cosa abbiamo bisogno di è una mappa, o la rete, di questi collegamenti. Che Cosa abbiamo identificato in questo progetto è un metodo più efficace per la fabbricazione della questa mappa.„
Il gruppo di ricerca - che scienziati inclusi dai campi di biologia, fisica, statistiche ed informatica a Brown, Università di Bologna in Italia ed Università di Tel Aviv nell'Israele - precisato per rispondere ad una domanda. Quando “un oncoprotein„ micidiale è inserita, che reazione a catena di attività di gene provoca?
La proteina, c-Myc, induce le celle a moltiplicarsi. Se la proteina è incontrollato prodotto, può causare il petto, il colon ed altri tipi di cancri. C-Myc contribuisce ogni anno a più di 70.000 morti negli Stati Uniti.
Una Volta Che l'opzione del c-Myc è gettata, migliaia di altri geni cominciano pompare fuori le proteine o inserire altri geni, che attiva ancora più geni. Un modo studiare questo Web delle connessioni sarebbe di provocare la reazione a catena e di studiarla col passare del tempo. Per fare che accade, i ricercatori Marroni hanno fornito un esperimento abile.
John Sedivy, un ricercatore da sempre del c-Myc ed il Direttore del Centro di Brown per Genomica e Proteomics, celle sviluppate del ratto che mancavano del gene del c-Myc. Queste celle più ulteriormente sono state modificate per fare un modulo della proteina del c-Myc, in grado di essere inserita/disinserita passato dal tamoxifene di cura ormonale.
Una serie di celle è stata curata con il tamoxifene, quindi ha raccolto un', due, quattro, otto e 16 ore più successivamente. Un'Altra serie di celle non ha ottenuto la droga ma è stata raccolta durante lo stesso calendario.
L'Analisi di attività di gene generata negli esperimenti ha rivelato 1.191 giocatore possibile nella rete del gene del c-Myc. Un gruppo statistico, piombo da Gastone Castellani, il professor di ricerca del socio con l'Istituto per il Cervello ed i Sistemi Neurali ed il professor al Università di Bologna, esaminati due metodi provare a modellare questa rete.
Uno era il modello Markoviano lineare, uno strumento di decenni utilizzato per sgranocchiare tutto dalle statistiche di sport a produzione di linguaggio. L'altro era un metodo di correlazione basato sulla teoria di rete, che è stata usata per spiegare i sistemi complessi quali le griglie di potenza e le reti neurali.