Comparado com um modelo linear longo-usado, um método estatístico correlação-baseado é uma maneira mais segura de traçar as interacções complexas do gene e os genes pontuais que podem ser alvos potenciais do tratamento contra o cancro, de acordo com a pesquisa nova de Brown University.
A pesquisa é importante porque descreve uma nova ferramenta prometedora para seguir conexões humanas do gene, uma tarefa crítica para compreender e tratar o cancro e as outras doenças. Os Resultados apareceram esta semana na edição em linha das Continuações da Academia Nacional das Ciências.
Os “Genes influenciam um outro em muitas maneiras intrincadas,” disse o Tanoeiro de Leon, o professor da física e da neurociência e o director do Instituto para o Cérebro e de Sistemas Neurais em Brown. “O Que nós precisamos são um mapa, ou a rede, destas relações. O Que nós identificamos neste projecto é um método mais eficaz para fazer este mapa.”
A equipa de investigação - que cientistas incluídos dos campos da biologia, a física, as estatísticas e a informática em Brown, o Università di Bolonha em Itália e a Universidade de Tel Aviv em Israel - expor para responder a uma pergunta. Quando um “oncoprotein mortal” é ligada, que reacção em cadeia da actividade de gene ele se ajusta fora?
A proteína, c-Myc, faz com que as pilhas multipliquem. Se a proteína é não-verificado produzido, pode causar o peito, os dois pontos e os outros tipos de cancro. C-Myc contribui a mais de 70.000 mortes nos Estados Unidos todos os anos.
Uma Vez Que o interruptor do c-Myc é jogado, os milhares de outros genes começam bombear para fora proteínas ou ligar outros genes, que activa ainda mais genes. Uma maneira de estudar esta Web das conexões seria ajustar-se fora da reacção em cadeia e estudá-lo ao longo do tempo. Para fazer que acontece, os pesquisadores de Brown vieram acima com uma experiência inteligente.
John Sedivy, um pesquisador velho do c-Myc e director do Centro de Brown para a Genómica e o Proteomics, pilhas desenvolvidas do rato que faltaram o gene do c-Myc. Estas pilhas foram alteradas mais para fazer um formulário da proteína do c-Myc, que poderia ser de ligar/desligar comutado pelo tamoxifen do tratamento hormonal.
Um grupo de pilhas foi tratado com o tamoxifen, a seguir colheu uma, dois, quatro, oito e 16 horas mais tarde. Um Outro grupo de pilhas não obteve a droga mas foi colhido durante o mesmo prazo.
A Análise da actividade de gene gerada nas experiências revelou 1.191 jogadores possíveis na rede do gene do c-Myc. Uma equipe estatística, conduzida por Gastone Castellani, um professor da pesquisa do associado com o Instituto para o Cérebro e Sistemas Neurais e um professor no Università di Bolonha, testados dois métodos tentar modelar esta rede.
Um era o modelo linear de Markov, uma ferramenta de há décadas usada para triturar tudo das estatísticas dos esportes à produção da língua. O outro era um método de correlação baseado na teoria de rede, que foi usada para explicar sistemas complexos tais como redes eléctricas e redes neurais.