Jämfört med ettanvänt linjärt modellera, är enbaserad statistisk metod ett pålitligare långt som kartlägger komplexa genväxelverkan, och exakt gener, som kan vara potentiell cancerbehandling, uppsätta som mål, enligt ny Brun Universitetarforskning.
Forskningen är viktig, därför att den beskriver ett lova nytt bearbetar för spårande människagenanslutningar, en uppgift som är kritisk för överenskommelse och behandlar cancer och andra sjukdomar. Resultat visades denna vecka i den on-line upplagan av Förfarandena av MedborgareAkademin av Vetenskaper.
”Genpåverkan en another i många invecklad väg,”, sade den Leon Cooperen, professor av fysik och neuroscience och direktören av Institutet för Hjärna och Neural System på Bruntet. ”Vad vi behöver är en kartlägga, eller knyta kontakt, av dessa anknyter. Projektera är en effektivare metod för danande som Vad vi har identifierat i detta, detta kartlägger.”,
Forskninglaget - som inklusive forskare från sätter in av biologi, fysik, statistik och datavetenskap på Bruntet, Università di Bologna i Italien och den Tel Aviv Universitetar i Israel - uppsättning ut som svarar en ifrågasätta. När en dödlig ”oncoprotein” kopplat på, är, vad kedjar reaktion av genaktivitet gör av den fastställd?
Proteinet, c-Myc, orsakar celler för att multiplicera. Om proteinet är producerat okontrollerat, kan det orsaka bröst, kolonet och andra typer av cancer. C-Myc bidrar till mer än 70.000 dödar i Förenta staterna varje år.
När cen-Myc kopplar kastas, tusentals startar andra gener att pumpa ut proteiner eller, koppla på andra gener, som aktiverar fortfarande mer gener. En långt till studien som denna rengöringsduk av anslutningar skulle, är till uppsättningen av den kedjareaktionen och studien det med tiden. Att göra, som händer, kom Bruna forskare upp med ett klyftigt experiment.
John Sedivy, en lång tidc-Mycforskare och direktören av Brunt Centrerar för Genomics, och Proteomics som framkallas tjaller celler som saknade c-Mycgenen. Dessa celler ändrades vidare för att göra en bilda av c-Mycproteinet, som kunde vara kopplat 'På/av' vid hormonbehandlingtamoxifenen.
Man grupperar av celler behandlades med tamoxifen, då skördade en, två, fyra, åtta och 16 timmar mer sistnämnd. Another grupperar av celler fick inte drogen utan skördades under den samma tiden inramar.
Analys av genaktivitet som frambragtes i experimenten, avslöjde 1.191 möjlighetspelare i c-Mycgenen knyter kontakt. Ett statistiskt lag, ledde vid Gastone Castellani, en förbunden forskningprofessor med Institutet för Hjärna, och Neural System och en professor på Universitàen di Bologna, det testade försök för två metoder att modellera detta knyter kontakt.
En var det linjära Markov modellerar, ettgammalt bearbetar van vid knastrande allt från sportstatistik till språkproduktionen. Annan var en korrelationmetod som baserades på, knyter kontakt teorin, som har varit van vid förklarar komplexa system liksom driver raster, och neural knyter kontakt.