العلماء في مختبر لورانس ليفرمور الوطني (LLNL) و مركز المعلوماتية الحيوية لينيوس (LCB) في جامعة أوبسالا في السويد قد وضعت تقنية جديدة لتحليل المعلومات البيولوجية بشكل منهجي المناطق الرئيسية في الحمض النووي التي تحكم نشاط الجين يساعد. وكان على رأس الجهود التعاونية التي تبذلها فيديليس كرزيستوف في الولايات المتحدة ويان كوموروفسكي في السويد.
فهم الآليات التنظيمية المعقدة التي تخبر الجينات عند التبديل وإيقاف هي واحدة من أصعب التحديات التي تواجه الباحثين في محاولة لاكتشاف كيفية الحياة الاشغال. يمكن "المواقع ملزم" ، أو المناطق من الحمض النووي التي تتفاعل مع البروتينات التي تساعد على التحكم في التعبير الجيني ، يكون على مسافة طويلة على حبلا من الحمض النووي من الجينات التي تؤثر. الأبحاث الحديثة أظهرت أيضا يمكن التحكم في التعبير الجيني من البروتينات التنظيمية عدة العمل معا في مجموعة من المواقع ملزمة مختلفة.
(تعرف البروتينات التنظيمية بأنها "عوامل النسخ" ؛ النسخ هو الخطوة الأولى في العملية التي يتم فك شفرتها المعلومات الجينية في الحمض النووي من خلية لتصنيع البروتينات ، اللبنات الأساسية للحياة.)
"من الصعب أن نلاحظ كيف تجريبيا عوامل النسخ ربط الحمض النووي على مسافة واحدة من الجين ، أو كيف يحدث التنظيم" ، وقال فيديليس ، وهو عالم أحياء في مديرية العلوم البيولوجية الحاسوبية ليفرمور. "ولكن يمكنك تحديد مواقعهم ملزم في منطقة المروج او تنظيمية -- عادة ما تكون هناك عدد قليل من هذه الجينات لكل أردنا أن نرى ما اذا كنا قد يستنتج بطريقة عوامل النسخ كم في الساعة ، أو مزيج من العوامل ، هي القادمة. معا جسديا وكيف يمكن لهذه المجموعات تنظيم الجينات. "
"ولتحقيق هذا الهدف" ، وقال كوموروفسكي "استخدمنا أسلوب التعلم آلة تسمى مجموعات الخام إلى نموذج رياضيا القواعد العامة التي يمكن أن مساعد معروف مواقع الربط والتعبير الجيني في الخميرة ، التي تعد واحدة من أكثر الكائنات درس على نطاق واسع". من تحليل نشاط الجينات في إطار مجموعة من الظروف البيئية ، وكانت فرق قادرة على تطوير مجموعة من القواعد للتنبؤ موقع تركيبات موقع ملزمة استنادا موقع ملزمة محدودة وبيانات التعبير الجيني.