Peneliti genetika telah mengembangkan sebuah chip gen disesuaikan untuk secara cepat memindai sampel tumor untuk perubahan DNA spesifik yang menawarkan petunjuk untuk prognosis dalam kasus neuroblastoma, bentuk umum dari kanker anak-anak.
Daripada meliputi seluruh genom, microarray berfokus pada daerah kromosom menduga tanda-tanda bahan genetik dihapus dikenal memainkan peran dalam kanker.
Para peneliti, dari Rumah Sakit Anak Philadelphia dan Thomas Jefferson University , mengatakan teknik mereka mungkin mudah disesuaikan untuk jenis kanker lainnya. Studi bukti-of-prinsip muncul di edisi Agustus Genome Research .
Salah satu keuntungan dari teknik mereka adalah fleksibilitas, kata rekan penulis John M. Maris, MD, seorang onkologi pediatrik di Rumah Sakit Anak Philadelphia. "Sebagai penelitian masa depan mengidentifikasi gen lain yang aktif dalam neuroblastoma, kita dapat memodifikasi microarray untuk memasukkan daerah seperti," tambahnya.
"Kami telah disesuaikan ini alat untuk neuroblastoma, tetapi pendekatan ini juga bisa disesuaikan dengan jenis lain kanker di mana perubahan DNA yang penting," kata co-penulis Paolo Fortina, MD, Ph.D., profesor kedokteran di Jefferson Medical College dari Thomas Jefferson University di Philadelphia dan kepala bagian, Genomics dan Diagnostik, di Departemen Kedokteran Jefferson Pusat untuk Translational Medicine.
Kanker yang paling umum ditemukan pada bayi, neuroblastoma pemogokan sistem saraf perifer, sering muncul sebagai tumor padat di dada anak atau perut. Beberapa jenis dari neuroblastoma yang risiko rendah, penyelesaian setelah ahli bedah menghilangkan tumor, sementara yang lain jauh lebih agresif. Mengidentifikasi tingkat risiko yang benar memungkinkan dokter untuk mengobati kanker agresif tepat, sementara tidak menundukkan anak-anak dengan risiko kanker rendah untuk overtreatment.
Kanker peneliti telah menunjuk kelainan genetik tertentu yang mempengaruhi agresivitas neuroblastoma. Kelainan penting adalah hilangnya heterozigositas (LOH), penghapusan satu salinan dari sepasang gen. Ketika gen yang terlibat adalah gen penekan tumor, LOH menghapus rem pada pertumbuhan sel yang tidak terkendali, pertumbuhan yang menjadi ciri khas kanker.
Para peneliti di laboratorium Dr Maris yang sebelumnya menetapkan bahwa LOH di daerah kromosom 11 memungkinkan neuroblastoma agresif untuk mengambil terus. Microarray baru dapat mendeteksi cacat gen seperti pada kromosom 11 dan wilayah genetik lain terlibat dalam neuroblastoma.
Mikroarray adalah silikon chip yang berisi pilihan erat memerintahkan bahan genetik di mana bahan sampel dapat diuji. Ketika DNA basis dari sampel untuk mengikat urutan komplementer pada microarray, mereka menyebabkan tag neon bersinar di bawah sinar laser. Ini merupakan sinyal bahwa variasi gen tertentu hadir dalam sampel.