Van Toepassing Zijnd math en de computers aan het drug-ontdekking proces, onderzoekers bij Rensselaer Polytechnic Institute hebben een methode ontwikkeld om eiwitscheidingsgedrag van eiwitstructuur direct te voorspellen.
Deze nieuwe multi-schaal eiwit modelleringsbenadering kan de tijd verminderen het neemt om geneesmiddelen aan markt te brengen en kan significante implicaties voor een serie van biotechnologietoepassingen, met inbegrip van het bioprocessing, drugontdekking, en proteomics, de studie van eiwitstructuur en functie hebben.
De „Vooruitlopende modellering is een nieuwe benadering van drugontdekking die informatie van laboratoriumanalyse neemt en het in vooruitlopende modellen concentreert die op een computer kunnen worden geëvalueerd,“ bovengenoemd Bondig M. Breneman, professor van chemie en chemische biologie in Rensselaer.
De „capaciteit om het scheidingsgedrag van een bepaalde proteïne van zijn structuur te voorspellen heeft direct aanzienlijke implicaties voor biotechnologieprocessen,“ bovengenoemde Steven Cramer, professor van chemische en biologische techniek in Rensselaer. De „onderzoekresultaten wijzen tot zover erop dat deze modelleringsbenadering kan worden gebruikt om eiwitgedrag voor gebruik in bioseparationtoepassingen, zoals de eiwitreinigingsmethodes te bepalen die in drugontdekking worden gebruikt. Dit kon de ontwikkelingstijd potentieel verminderen die wordt vereist om biopharmaceuticals aan markt te brengen.“
De modelleringstechniek is gebaseerd op methodes die eerder door de Groep van Breneman voor snel het voorspellen van de doeltreffendheid en de bijwerkingen van kleine drug-als molecules worden ontwikkeld. Het pas ontwikkelde model voorspelde met succes de hoeveelheid proteïne die aan een materiaal onder een waaier van voorwaarden door moleculaire informatie bindt te gebruiken die uit de eiwitstructuur wordt verkregen. Deze voorspelde parameters van de adsorptieisotherm herhaalden toen experimentele resultaten door het daadwerkelijke scheidingsprofiel van proteïnen in chromatografische kolommen te voorspellen. De technieken van de Chromatografie worden gebruikt om molecules te identificeren en te zuiveren, in dit geval, bijzondere proteïnen.