Un chercheur de Rensselaer a développé un nouvel outil pour aider à éclaircir la fonction d'une structure d'ADN insaisissable. Les conclusions, qui ont été présentées aujourd'hui lors de la réunion nationale 230e de l' American Chemical Society (ACS) à Washington, D.C., pourraient conduire à une meilleure compréhension des maladies comme le cancer et le diabète.
La version standard du génome humain est une hélice double brin de bases complémentaires : adénine se lie à la thymine et cytosine se lie à la guanine. « Notre attention sur un autre type de structure de l'ADN, le « G-quartet, » qui découle des liaisons hydrogènes entre guanines seulement, » explique Linda McGown, professeur et président du département de chimie et biologie chimique au Rensselaer Polytechnic Institute.
Les scientifiques ont longtemps spéculé sur l'existence de ces G-quatuors, ainsi que le rôle qu'ils peuvent jouer dans le corps humain, mais la preuve directe est resté insaisissable. Pour aider à répondre à ces questions, McGown et ses étudiants à Rensselaer et Duke University étudient cette structure inhabituelle, qui est un tableau rectangulaire de quatre guanines, chacune des liaisons hydrogènes à ses deux plus proches voisins.
McGown a élaboré une stratégie de « protéomiques dirigée » pour comparer les profils de liaison aux protéines G-quartet dans différentes populations de cellules. « Il s'agit essentiellement d'une expérience de pêche à l'aide de crochets composés de G-quartet-formant des séquences du génome de l'ADN, dans l'espoir d'attraper des protéines qui pourraient lier à de telles structures dans le noyau humain, » dit-elle. McGown a récemment découvert que l'insuline se lie à un G-quatuor formé par une séquence qui se produit dans le gène promoteur de l'insuline.