Los Científicos de la Universidad de Delaware han hecho un avance importante en el estudio de los pequeños ácidos ribonucleicos (RNAs), descubriendo un RNAs 10 veces más pequeño en la instalación Arabidopsis que había sido determinado previamente. El avance está señalado en la aplicación de Sept. del 2 el alimentador de la Ciencia.
La investigación conducto a lo largo el año y medio pasado por las personas de los laboratorios dirigidos por Pamela J. Green, Silla de Crawford H. Greenewalt Endowed en Biología Molecular de la Instalación, una cita común en el Departamento de las Ciencias de la Instalación y de Suelo y la Universidad de Estudios Marinos, y Blake C. Meyers, profesor adjunto de la instalación y ciencias de suelo en la Universidad de la Agricultura y de los Recursos Naturales.
Para determinar el pequeño RNAs, los científicos utilizaron la tecnología de perfilado transcriptiva llamada Masivo la Firma Paralela Que Ordenaba (MPSS), que fue desarrollada por Solexa Inc. de Hayward, California.
El Verde y Meyers promovieron la aplicación de MPSS a pequeño RNAs en colaboración con científicos en Solexa.
El Verde dijo que pequeño RNAs es “uno de la mayoría de los descubrimientos importantes en biotecnología en los 10 años pasados” porque desempeñan un papel importante en genes de regulación en instalaciones y animales.
Las Deficiencias en la pequeña producción del ARN pueden tener un efecto profundo sobre el revelado, y pequeño RNAs se ha asociado a otros procesos biológicos importantes, tales como reacciones a la tensión.
La Determinación de la serie del pequeño RNAs de un organismo es crítica para entender su impacto total y los papeles biológicos individuales, Meyers dijo.
Aunque varios miles pequeño RNAs se haya determinado de sistemas diversos de la instalación y del animal, estas series fueron determinadas usando más viejas tecnologías que no ordenan profundamente bastante para caracterizar estas moléculas en una escala genoma-ancha. La información Cuantitativa sobre la abundancia y la regla de la mayoría de pequeño RNAs también ha estado faltando.
Con el financiamiento del National Science Foundation, los laboratorios del Verde y Meyers, que se contienen en el Instituto de la Biotecnología de Delaware, superaron estos obstáculos de hacer un descubrimiento en el estudio de pequeño RNAs de Arabidopsis.
Antes de su trabajo, los científicos por todo el mundo en un proceso cuidadosamente lento y necesitando mucho trabajo habían documentado cerca de 6.000 pequeño RNAs de la instalación.
Meyers había estado ordenando RNAs en arroz y Arabidopsis usando MPSS cuando el Verde se acercó a él sobre la posibilidad de ordenar pequeño RNAs usando la tecnología de MPSS.
“Sabíamos que MPSS podría trabajar en la secuencia de pequeño RNAs pero no éramos cómo es interesante sería el resultado,” Meyers seguro dijimos. “Pero, tan pronto como recibiéramos el primer conjunto de datos completo, vimos rápidamente que era lejos más rico y más complejo que cualquier persona habíamos generado previamente para este tipo de molécula.”
Mientras Que progresó el proyecto, los laboratorios ordenaron cerca de 2,2 millones de pequeños RNAs de los almácigos y de las flores de la instalación y determinaron más de 75.000 diversas pequeñas series del ARN.
“No sólo MPSS proporciona a cubrimiento muy profundo de pequeño RNAs, pero también proporciona a la información cuantitativa,” Green dijo, agregando eso “que éste permitió muchos reguló altamente pequeño RNAs que se determinará.”
Además del número escarpado de series determinadas, Meyers dijo que “la sorpresa más grande de las conclusión es la diversidad.” Él dijo que sus datos indicaron que las regiones de los cromosomas donde había especulado la gente allí no eran mucha actividad transcriptiva resultada para ser sitios de cantidades enormes de pequeña actividad del ARN.