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重大的進步,在小核糖核酸的研究

Published on September 1, 2005 at 4:52 PM · No Comments

特拉華大學的科學家們取得了一個重大的進步,在小核糖核酸(核糖核酸)的研究發現植物擬南芥的10倍以上的小分子RNA比以前已經確定。提前在9月2日發行的“科學”雜誌報導。

這項研究是在去年由由Pamela J.格林為首的實驗室團隊半進行,克勞福德 H. Greenewalt賦予主席在植物分子生物學,植物和土壤科學系聯合任命和海洋研究,布雷克C.邁爾斯,植物和土壤科學助理教授,在農業和自然資源學院的學院。

為了確定小分子RNA,科學家利用轉錄譜技術的大規模並行簽字測序(MPSS),這是由加利福尼亞州海沃德,公司Solexa公司開發

綠色和邁爾斯首創的應用 MPSS,與在公司Solexa的科學家合作的小分子RNA。

格林說,小分子RNA“在過去 10年來在生物技術中最重要的發現之一”,因為他們發揮了重要作用,在調節基因在植物和動物。

在小分子RNA產量的不足之處,可以有一個發展產生深遠的的影響,並已與其他重要的生物過程,如對應激反應,小分子RNA。

邁耶斯說,確定一個有機體的小分子RNA的序列是了解他們的整體影響和個人的生物學作用的關鍵。

雖然從不同的植物和動物系統已確定了幾千年的小分子RNA,這些序列被確定不序列足夠深的特點在全基因組的規模,這些分子使用舊的技術。有關大多數小分子RNA的豐度和調控的定量信息也有所欠缺。

在國家科學基金會,綠色和邁爾斯,這是設在美國特拉華州生物技術研究所的實驗室,的資助,克服這些障礙,使從擬南芥的小分子RNA的研究中取得突破。

在此之前他們的工作,記錄了全世界的科學家在一個極為緩慢和勞動力密集的過程,從植物約 6000小分子RNA。

邁爾斯已測序的RNA在水稻和擬南芥使用MPSS綠色走近他的小分子RNA測序使用MPSS技術的可能性。

“我們知道,MPSS小分子RNA測序工作,但我們並沒有確定的結果將是多麼有趣,”邁爾斯說。 “但是,只要我們收到的第一套完整的數據,我們很快看到,這是更豐富,更複雜,比任何人以前對這種類型的分子產生。”

隨著項目的進展,實驗室測序的植物從幼苗和花約 220萬的小分子RNA,並確定了超過 75,000種不同的小分子RNA序列。

“不僅 MPSS提供了非常深刻的小分子RNA的覆蓋面,而且還提供了定量信息,”格林說,補充說:“這使得許多高度管制的小分子RNA被識別。”

確定序列的數量之多,此外,邁爾斯說:“最大的驚喜的結果是多樣性。”他說,他們的數據表明,人猜測的染色體區域沒有太多的轉錄活性橫空出世了大量的小分子RNA的活性網站。

格林說,他們的研究結果的影響,對未來的研究中有重要影響他們的實驗室和其他機構的。 “我們發現的是剛開始的時候,因為所帶來的後果超越了這種方式,”她說。 “未來的興奮會導致不同的實驗室測試後,在尋找自己喜愛的基因或染色體區域中的數據的新思路。”她解釋說,因為小分子RNA在其複雜的生物系統中的大量基因調控的重要的研究領域正在蓬勃發展。其中小分子RNA可以調節多個基因,研究人員認為,than10%的人類基因是由小分子RNA調節。

長度約 21至24個核苷酸的小分子RNA的特點。生物活性的小分子RNA,首次描述了大約 12年前,但在這一領域的最重大進展,只有在過去的六,七年。

為了幫助其他的小分子RNA的研究人員,UD的團隊已經創建了一個用戶友好的網站 [http://mpss.udel.edu/at]提供給科學家研究任何匹配的小分子RNA的擬南芥染色體的基因或地區。