Wissenschaftler von der Universität von Delaware haben ein beträchtliches Fortschritt in der Studie von kleinen Ribonuclein- Säuren (RNAs) gemacht und 10mal kleineres RNAs in der Pflanze Arabidopsis entdeckt, als vorher gekennzeichnet worden war. Der Fortschritt wird in der Ausgabe Sept. 2 der Wissenschaftszeitschrift berichtet.
Die Forschung wurde im Laufe der letzten Jahr- und Hälfte von den Teams von den Labors geleitet, die von Pamela J. Green, Stuhl Crawfords H. Greenewalt Endowed in der PflanzenMOLEKULARBIOLOGIE, in einer gemeinsamen Verabredung in der Abteilung von Pflanzen-und Schmutz-Wissenschaften und im College von MarineStudien und in Blake C. Meyers, Assistenzprofessor der Pflanze und Schmutzwissenschaften im College der Landwirtschaft und der Naturressourcen vorangegangen wurden.
Um das kleine RNAs zu kennzeichnen, setzten die Wissenschaftler die transcriptional ein Profil erstellende Technologie ein, die Enorm die Parallele Sequenziell Ordnende Unterzeichnung genannt wurde (MPSS), die durch Solexa Inc. von Hayward, Calif entwickelt wurde.
Grün und Meyers gingen mit der Anwendung von MPSS zu kleinem RNAs gemeinsam mit Wissenschaftlern bei Solexa voran.
Grün sagte, dass kleines RNAs „eine der meisten wichtigen Entdeckungen in der Biotechnologie in den letzten 10 Jahren“ sind, weil sie eine wichtige Rolle in regelnden Genen in beiden Pflanzen und Tiere spielen.
Fehlbeträge in der kleinen RNS-Produktion können einen profunden Effekt auf Entwicklung haben, und kleines RNAs haben sich auf andere wichtige biologische Prozesse, wie Antworten zum Druck bezogen.
Die Reihenfolge des kleinen RNAs eines Organismus Zu Bestimmen ist für das Verständnis ihrer Gesamtauswirkung kritisch und einzelne biologische Rollen, Meyers sagte.
Obgleich einiges tausend kleines RNAs von den verschiedenen Pflanzen und Tiere-Anlagen gekennzeichnet worden sind, wurden diese Reihenfolgen unter Verwendung der älteren Technologien gekennzeichnet, die nicht tief genug sequenziell ordnen, um diese Moleküle auf einer Genom-weiten Schuppe zu kennzeichnen. Quantitative Informationen über den Überfluss und die Regelung der Mehrheit von kleinem RNAs auch haben ermangelt.
Mit Finanzierung von der National Science Foundation, glichen die Labors des Grüns und Meyers, die am Delaware-Biotechnologie-Institut untergebracht werden, diese Hindernisse aus, einen Durchbruch in der Studie von kleinem RNAs von Arabidopsis zu machen.
Vor ihrer Arbeit hatten Wissenschaftler weltweit in einem sorgfältig langsamen und arbeitsintensiven Prozess ungefähr 6.000 kleines RNAs von der Pflanze dokumentiert.
Meyers hatte RNAs im Reis und Arabidopsis unter Verwendung MPSS sequenziell geordnet, als Grün ihm über die Möglichkeit des Sequenziell ordnens von kleinem RNAs unter Verwendung der MPSS-Technologie sich näherte.
„Wir wussten, dass MPSS arbeiten könnte, wenn es kleines RNAs sequenziell ordnete, aber wir nicht sicherer, wie interessant das Ergebnis sein würde,“ Meyers sagten waren. „Aber, sobald wir die erste komplette Datei empfingen, sahen wir schnell, dass sie weit reicher und komplexer war, als jedermann hatten vorher erzeugt für dieses Baumuster des Moleküls.“
Während das Projekt weiterkam, ordneten die Labors ungefähr 2,2 Million kleines RNAs von den Sämlingen und von den Blumen der Pflanze sequenziell und kennzeichneten mehr als 75.000 verschiedene kleine RNS-Reihenfolgen.
„Nicht nur liefert MPSS sehr tiefe Dichte von kleinem RNAs, aber es liefert auch quantitative Informationen,“ sagte Green und fügte das hinzu, „, das dieser viele regelte in hohem Grade kleines gekennzeichnet zu werden gewährte RNAs.“
Zusätzlich zur bloßen Anzahl von den gekennzeichneten Reihenfolgen, sagte Meyers, dass „die größte Überraschung in den Ergebnissen ist die Verschiedenartigkeit.“ Er sagte, dass ihre Daten anzeigten, dass die Regionen der Chromosomen, in denen Leute spekuliert hatten, dort nicht viel transcriptional Aktivität waren, die ausgefallen wurde, um Sites von enormen Mengen der kleinen RNS-Aktivität zu sein.