Gli Scienziati dall'Università di Delaware hanno fatto un avanzamento significativo nello studio di piccoli acidi ribonucleici (RNAs), scoprente RNAs 10 volte più piccolo nell'impianto Arabidopsis che precedentemente era stato identificato. L'avanzamento è riferito nell'emissione del 2 settembre del caricatore di Scienza.
La ricerca è stata condotta nel corso di ultimo anno e mezzo dai gruppi dai laboratori intestati da Pamela J. Green, Presidenza di Crawford H. Greenewalt Endowed nella Biologia Molecolare dell'Impianto, in una nomina unita nel Dipartimento dell'Impianto e delle Geologia E nell'Istituto Universitario degli Studi Marini ed in Blake C. Meyers, assistente universitario dell'impianto e le geologia nell'Istituto Universitario dell'Agricoltura e delle Risorse Naturali.
Per identificare il piccolo RNAs, gli scienziati hanno usato la tecnologia di delineamento trascrizionale chiamata In Maniera Massiccia Impronta Parallela che Ordina (MPSS), che è stata sviluppata da Solexa Inc. di Hayward, la California.
Il Verde e Meyers hanno aperto la strada all'applicazione di MPSS a piccolo RNAs in collaborazione con gli scienziati a Solexa.
Il Verde ha detto che piccolo RNAs è “una della maggior parte delle scoperte importanti in biotecnologia durante i 10 anni ultimi„ perché svolgono un ruolo importante in geni di regolamentazione sia in piante che in animali.
Le Carenze nella produzione debole del RNA possono avere un effetto profondo sullo sviluppo e piccolo RNAs è stato associato con altri trattamenti biologici importanti, quali le risposte allo sforzo.
La Determinazione della sequenza di piccolo RNAs di un organismo è critica per la comprensione del loro impatto globale e diversi ruoli biologici, Meyers ha detto.
Sebbene parecchie migliaia piccolo RNAs sia stato identificato dai diversi sistemi dell'animale e della pianta, queste sequenze sono state identificate facendo uso di più vecchie tecnologie che non ordinano abbastanza profondamente per caratterizzare queste molecole su un disgaggio genoma di ampiezza. Le informazioni Quantitative sull'abbondanza e sul regolamento della maggior parte di piccolo RNAs egualmente stanno mancando di.
Con il finanziamento dal National Science Foundation, i laboratori di Verde e Meyers, che sono alloggiati all'Istituto di Biotecnologia del Delaware, hanno superato questi ostacoli fare un'innovazione nello studio di piccolo RNAs da Arabidopsis.
Prima del loro lavoro, gli scienziati universalmente in un trattamento scrupoloso lento ed a forte intensità di mano d'opera avevano documentato circa 6.000 piccolo RNAs dall'impianto.
Meyers stava ordinando RNAs in riso e Arabidopsis facendo uso di MPSS quando il Verde si è avvicinato circa la possibilità di ordinamento del RNAs piccolo facendo uso della tecnologia di MPSS.
“Abbiamo saputo che MPSS potrebbe lavorare nell'ordinamento del RNAs piccolo ma non eravamo quanto interessante il risultato sarebbe stato,„ Meyers sicuro abbiamo detto. “Ma, non appena abbiamo ricevuto il primo insieme di dati completo, abbiamo veduto rapidamente che era ben più ricco e più complesso di chiunque precedentemente avevamo generato per questo tipo di molecola.„
Mentre il progetto ha progredito, i laboratori hanno ordinato circa 2,2 milione piccoli RNAs dalle piantine e dai fiori dell'impianto ed hanno identificato più di 75.000 piccole sequenze differenti del RNA.
“Non solo MPSS fornisce la copertura molto profonda di piccolo RNAs, ma egualmente fornisce informazioni quantitative,„ Green ha detto, aggiungendo quello “che questo ha conceduto molti altamente ha regolamentato piccolo RNAs da identificare.„
Oltre al numero puro delle sequenze identificate, Meyers ha detto che “la più grande sorpresa nei risultati è la diversità.„ Ha detto che i loro dati hanno indicato che le regioni dei cromosomi in cui la gente aveva speculato là non erano molta attività trascrizionale risultata per essere siti delle somme enormi di piccola attività del RNA.