デラウェア大学からの科学者は前に識別されてしまったよりプラント Arabidopsis の 10 倍より小さい RNAs を検出する小さいリボ核酸 (RNAs) の調査の重要な前進をしました。 前進は科学マガジンの 9 月 2 日問題で報告されます。
研究はプラントおよび土科学の部門および農業および天然資源の大学で海洋の調査の大学でパメラ J. Green のプラント分子生物学、共同任命、およびブレイクプラントの C. Meyers、のクローフォード H. Greenewalt Endowed の椅子が助教授および土科学先頭に立った実験室からのチームによって最後の年および半分の間に行なわれました。
小さい RNAs を識別するためには、科学者は大きく呼出された transcriptional 側面図を描く技術を配列する Hayward の (MPSS) Solexa Inc. によって開発された平行署名、カリフォルニア使用しました。
緑および Meyers は Solexa で科学者と共同して小さい RNAs に MPSS のアプリケーションを開拓しました。
緑はそれらが野生動植物両方の調整の遺伝子の重要な役割を担うので小さい RNAs が 「最後の 10 年の人間工学のほとんどの重要な発見の 1 つ」であると言いました。
小さい RNA の生産の不足は開発に対する深遠な効果をもたらすことができ小さい RNAs は圧力への応答のような他の重要な生物学的過程と、関連付けられました。
有機体の小さい RNAs のシーケンスを定めることは全面的な影響を理解するために重大であり、個々の生物的役割と、 Meyers 言いました。
数千小さい RNAs が多様な野生動植物システムから識別されたが、これらのシーケンスはゲノム全体のスケールのこれらの分子を特徴付けるには十分に深く配列しないより古い技術を使用して識別されました。 多量そして規則のずっと小さい RNAs の大半についての定量的情報はまた欠けています。
全米科学財団からの資金調達によって、デラウェア州人間工学の協会で収容される Meyers および緑の実験室は Arabidopsis から小さい RNAs の調査の進歩をするこれらの障害を克服しました。
彼らの作業前に、世界的の科学者は実直に遅く、労働集約的なプロセスでプラントからの約 6,000 小さい RNAs を文書化しました。
Meyers は MPSS を使用して緑が MPSS の技術を使用して小さい RNAs を配列する可能性についての彼に近づく前に米の RNAs およびずっと Arabidopsis を配列していました。
「私達は興味深い結果がどのようにあるか MPSS が小さい RNAs の配列ではたらくことができるが、私達が確実ではないと」、 Meyers 言ったことをではなかったことを確認しました。 「しかし、私達が最初の完全なデータセットを受け取ったらすぐ、私達はこのタイプの分子のためにすぐにずっとより豊富、複雑だったことを見ましたよりだれでも前に生成してしまった」。
プロジェクトが進歩したと同時に、実験室はプラントの実生植物そして花からの約 2.2 百万小さい RNAs を配列し、 75,000 以上の小さい RNA シーケンスを識別しました。
「MPSS しか提供しま小さい RNAs の非常に深い適用範囲をし、しかしまた定量的情報を提供しま」、 Green は言いま、それを追加します 「これが割り当てた多数を非常に調整した識別されるべき小さい RNAs を」。
識別されたシーケンスの薄い番号に加えて Meyers は 「調査結果の最も大きい驚き多様性」。がであることを言いました 彼は人々がそこに推測した染色体の領域が小さい RNA の作業の途方もない量のサイトであるためになった多くの transcriptional 作業ではなかったことをデータが示したと言いました。