Naukowowie od uniwersyteta Delaware robili znaczącemu postępowi w nauce mali rybonukleinowi kwasy, odkrywa 10 czasów małego RNAs w roślinie Arabidopsis (RNAs) niż poprzednio utożsamiał. Postęp donosi w Sept. 2 zagadnieniu nauka magazyn.
Badanie prowadził nad kursem ostatni rok i połówka drużynami od laboratoriów przewodzących Pamela J. zielenią, Crawford H. Greenewalt Obdarzał krzesła w rośliny Cząsteczkowej biologii, łącznym spotkaniu w i Blake C dziale i szkole wyższa żołnierzy piechoty morskiej studia roślina i Glebowe nauki. Meyers asystent profesora roślina i glebowe nauki w szkole wyższa, rolnictwo i surowce naturalni.
Utożsamiać małego RNAs używali transcriptional profiluje technologię dzwoniącą Masowo Równoległy podpis (MPSS) który rozwijał Solexa Inc. Hayward, Calif. naukowowie Uporządkowywa,
Zieleń i Meyers zapoczątkowywaliśmy zastosowanie MPSS mały RNAs we współpracy z naukowami przy Solexa.
Zieleń powiedział że mały RNAs jest "jeden najwięcej znacząco odkrycie w biotechnologii w ostatnich 10 rok" ponieważ bawić się znacząco rola w regulacyjnych genach w oba roślina i zwierzę.
Niedostatki w małej RNA produkci mogą mieć dogłębnego skutek na rozwoju, i mały RNAs kojarzył z innymi znacząco biologicznymi procesami tak jak odpowiedzi stres.
Ustalać sekwencję mały RNAs organizm jest krytyczny dla rozumieć ich całkowitego wpływ i indywidualni biologiczni rola, Meyers powiedział.
Chociaż kilka tysiąc małych RNAs utożsamiał od różnorodnych roślina i zwierzę systemów, te sekwencje utożsamiali używać stare technologie które no uporządkowywają charakteryzować te molekuły na szerokiej skala głęboko dosyć. Ilościowa informacja o przepisie większość mały RNAs i obfitości także brakował.
Z finansowaniem od narodowej fundaci naukowa laboratoria zieleń i Meyers pokonywali te przeszkody robić przełomowi w nauce mały RNAs od Arabidopsis., które mieścą przy Delaware biotechnologii instytutem,
Przed ich pracą, naukowowie na całym świecie w starannie pracochłonnym i wolnym procesie dokumentowali wokoło 6.000 mały RNAs od rośliny.
Meyers uporządkowywał RNAs w ryż i Arabidopsis używać MPSS gdy zieleń zbliżał się on o możliwości uporządkowywać małego RNAs używać MPSS technologię.
Znaliśmy MPSS mógł pracować w uporządkowywać małego RNAs ale no byliśmy pewny" Meyers powiedzieliśmy. "jak ciekawić wynika był," "Ale, szybko zobaczyliśmy jak tylko otrzymywaliśmy pierwszy zupełnego dane set, że ono był daleko bogaty i powikłany niż anyone poprzednio wytwarzaliśmy dla ten typ molekuła."
Gdy projekt rozwijał się laboratoria uporządkowywali wokoło 2,2 milion małego RNAs od, utożsamiali więcej niż 75.000 różnych małych RNA sekwencj i. kwiatów roślina i rozsad
"Nie tylko zapewnia bardzo zgłębiać sprawozdanie mały RNAs MPSS, ale ono także zapewnia ilościową informację," Zielenieje powiedział, dodający to "to pozwolił dużo wysoce regulował małego RNAs utożsamiać."
W dodatku do zwykłą liczbą sekwencje utożsamiać, Meyers powiedział "duża niespodzianka w znalezieniach jest różnorodnością." Powiedział że ich dane wskazywali że regiony chromosomy tam no byli dużo transcriptional aktywności obracającego out być miejsc olbrzymie kwoty mała RNA aktywność. dokąd ludzie spekulowali