Os Cientistas da Universidade de Delaware fizeram um avanço significativo no estudo de ácidos ribonucléicos pequenos (RNAs), descobrindo RNAs 10 vezes menor na planta Arabidopsis do que tinha sido identificado previamente. O avanço é relatado na introdução Sept. do 2 do compartimento da Ciência.
A pesquisa foi conduzida no curso do último ano e meio por equipes dos laboratórios dirigidos por Pamela J. Verde, Cadeira de Crawford H. Greenewalt Dotação na Biologia Molecular da Planta, em uma nomeação comum no Departamento de Ciências da Planta e de Solo e na Faculdade de Estudos Marinhos, e em Blake C. Meyers, professor adjunto da planta e ciências de solo na Faculdade da Agricultura e de Recursos Naturais.
Para identificar o RNAs pequeno, os cientistas usaram a tecnologia de perfilamento transcricional chamada Maciça a Assinatura Paralela que Arranja Em Seqüência (MPSS), que foi desenvolvida por Solexa Inc. de Hayward, Califórnia.
O Verde e Meyers abriram caminho a aplicação de MPSS a RNAs pequeno em colaboração com cientistas em Solexa.
O Verde disse que RNAs pequeno é “uma da maioria de descobertas importantes na biotecnologia nos últimos 10 anos” porque jogam um papel importante em genes de regulamento em ambos os vegetais e animal.
As Deficiências na produção pequena do RNA podem ter um efeito profundo na revelação, e RNAs pequeno foi associado com outros processos biológicos importantes, tais como respostas ao esforço.
Determinar a seqüência do RNAs pequeno de um organismo é crítica para compreender seu impacto total e papéis biológicos individuais, Meyers disse.
Embora diverso mil RNAs pequenos fossem identificados dos sistemas diversos do vegetal e animal, estas seqüências foram identificadas usando umas tecnologias mais velhas que não arranjassem em seqüência profundamente bastante para caracterizar estas moléculas em uma escala genoma-larga. A informação Quantitativa sobre a abundância e o regulamento da maioria de RNAs pequeno tem faltado igualmente.
Com o financiamento do National Science Foundation, os laboratórios do Verde e Meyers, que são abrigados no Instituto da Biotecnologia de Delaware, superaram estes obstáculos fazer uma descoberta no estudo de RNAs pequeno de Arabidopsis.
Antes de seu trabalho, os cientistas no mundo inteiro em um processo cuidadosa lento e trabalho-intensivo tinham documentado aproximadamente 6.000 RNAs pequeno da planta.
Meyers tem arranjado em seqüência RNAs no arroz e no Arabidopsis usando MPSS quando o Verde o aproximou sobre a possibilidade de arranjar em seqüência RNAs pequeno usando a tecnologia de MPSS.
“Nós soubemos que MPSS poderia trabalhar em arranjar em seqüência RNAs pequeno mas nós não éramos certo como interessante o resultado seria,” Meyers dissemos. “Mas, assim que nós recebêssemos a primeira série de dados completa, nós vimos rapidamente que era distante mais rica e mais complexa do que qualquer um tínhamos gerado previamente para este tipo de molécula.”
Enquanto o projecto progrediu, os laboratórios arranjaram em seqüência aproximadamente 2,2 milhão RNAs pequenos das plântulas e das flores da planta e identificaram mais de 75.000 seqüências pequenas diferentes do RNA.
“Faz Não somente MPSS fornece a cobertura muito profunda de RNAs pequeno, mas igualmente fornece a informação quantitativa,” Verde disse, adicionando isso “que este reservou muitos regulou altamente RNAs pequeno a ser identificado.”
Além do que o número completo de seqüências identificadas, Meyers disse que “a surpresa a mais grande nos resultados é a diversidade.” Disse que seus dados indicaram que as regiões dos cromossomas onde os povos tinham especulado lá não eram muita actividade transcricional despejada ser locais das quantidades enormes de actividade pequena do RNA.