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重大的进步,在小核糖核酸的研究

Published on September 5, 2005 at 6:29 AM · No Comments

特拉华大学的科学家们取得了一个重大的进步,在小核糖核酸(核糖核酸)的研究发现植物拟南芥的10倍以上的小分子RNA比以前已经确定。提前报道,在9月2日的“科学”杂志上的问题。

这项研究是在去年由由Pamela J.格林为首的实验室团队半进行,克劳福德H. Greenewalt赋予主席在植物分子生物学,植物和土壤科学系联合任命和海洋研究,布雷克C.迈尔斯,植物和土壤科学助理教授,在农业和自然资源学院的学院。

为了确定小分子RNA,科学家利用转录谱技术的大规模并行签字测序(MPSS),这是由加利福尼亚州海沃德,公司Solexa公司开发

绿色和迈尔斯首创的应用MPSS,与在公司Solexa的科学家合作的小分子RNA。

格林说,小分子RNA“在过去10年来在生物技术中最重要的发现之一”,因为他们发挥了重要作用,在调节基因在植物和动物。

在小分子RNA产量的不足之处,可以有一个发展产生深远的的影响,并已与其他重要的生物过程,如对应激反应,小分子RNA。

迈耶斯说,确定一个有机体的小分子RNA的序列是了解他们的整体影响和个人的生物学作用的关键。

虽然从不同的植物和动物系统已确定了几千年的小分子RNA,这些序列被确定不序列足够深的特点在全基因组的规模,这些分子使用旧的技术。有关大多数小分子RNA的丰度和调控的定量信息也有所欠缺。

在国家科学基金会,绿色和迈尔斯,这是设在美国特拉华州生物技术研究所的实验室,的资助,克服这些障碍,使从拟南芥的小分子RNA的研究中取得突破。

在此之前他们的工作,记录了全世界的科学家在一个极为缓慢和劳动力密集的过程,从植物约6000小分子RNA。

迈尔斯已测序的RNA在水稻和拟南芥使用MPSS绿色走近他的小分子RNA测序使用MPSS技术的可能性。

“我们知道,MPSS小分子RNA测序工作,但我们并没有确定的结果将是多么有趣,”迈尔斯说。 “但是,只要我们收到的第一套完整的数据,我们很快看到,这是更丰富,更复杂,比任何人以前对这种类型的分子产生。”

随着项目的进展,实验室测序的植物从幼苗和花约220万的小分子RNA,并确定了超过75,000种不同的小分子RNA序列。

“不仅MPSS提供了非常深刻的小分子RNA的覆盖面,而且还提供了定量信息,”格林说,补充说:“这使得许多高度管制的小分子RNA被识别。”

确定序列的数量之多,此外,迈尔斯说:“最大的惊喜的结果是多样性。”他说,他们的数据表明,人猜测的染色体区域没有太多的转录活性横空出世了大量的小分子RNA的活性网站。

格林说,他们的研究结果的影响,对未来的研究中有重要影响他们的实验室和其他机构的。 “我们发现的是刚开始的时候,因为所带来的后果超越了这种方式,”她说。 “未来的兴奋会导致不同的实验室测试后,在寻找自己喜爱的基因或染色体区域中的数据的新思路。”她解释说,因为小分子RNA在其复杂的生物系统中的大量基因调控的重要的研究领域正在蓬勃发展。其中小分子RNA可以调节多个基因,研究人员认为,than10%的人类基因是由小分子RNA调节。

长度约21至24个核苷酸的小分子RNA的特点。生物活性的小分子RNA,首次描述了大约12年前,但在这一领域的最重大进展,只有在过去的六,七年。

为了帮助其他的小分子RNA的研究人员,UD的团队已经创建了一个用户友好的网站[http://mpss.udel.edu/at]提供给科学家研究任何匹配的小分子RNA的拟南芥染色体的基因或地区。

科学是由美国科学促进协会出版的权威杂志。该论文的第一和第二作者郑陆,分子生物学博士后研究员,Shivakundan辛格TEJ,计算机科学的学生。也属于作者,除了绿色和迈尔斯,是蜀郡罗和基督教D. Haudenschild的公司Solexa。

“工作紧密结合起来,与工业合作者,”格林说,“他们的常规训练的学生和博士后越过的界限。模拟UD和DBI的跨学科研究,教育和经济发展的目标。”

除了由NSF的经费,实验室已收到从DBI和美国农业部的拨款,继续他们的小分子RNA分析的工作。

http://www.udel.edu/