Forskare från Universitetar av Delaware har gjort ett viktigt för- i studien av lilla ribonucleic syror (RNAs) som upptäcker 10 tider mindre RNAs i växten Arabidopsis, än föregående hade identifierats. Det för- anmälas i Sept.en 2 utfärdar av Vetenskapstidskriften.
Forskningen förades över jaga av i fjol och en halva av lag från de hövdade laboratoriumna av Pamela J. Göra Grön, den Crawford H. Greenewalt Begåva Stolen i Molekylär Biologi för Växt, en gemensam tidsbeställning i Avdelningen av Växten och Smutsar Vetenskaper och Högskolan av Marin- Studier och Blake C. Meyers, assistentprofessor av växten och smutsar vetenskaper i Högskolan av Jordbruk och Naturresurser.
Att identifiera den små RNAsen, använde forskarna den transcriptional profilera teknologin som kallades Kraftigt Parallell HäfteOrdnande i viss följd (MPSS), som framkallades av Solexa Inc. av Hayward, Calif.
Gräsplan och Meyers bana väg för applikationen av MPSS till små RNAs i samarbete med forskare på Solexa.
Gräsplan sade att små RNAs är ”en av mest viktiga upptäckter i bioteknik i jumbon 10 år”, därför att de leker en viktig roll i reglerande gener i båda växter och djur.
Brister i liten RNAproduktion kan ha ett djupsinnigt att verkställa på utveckling, och små RNAs har varit tillhörande med annat viktigt biologiskt bearbetar, liksom svar till spänningen.
Det är kritiskt Att Bestämma ordna av den små RNAsen av en organism för överenskommelse som deras overall får effekt, och biologiska roller för individen, Meyers sade.
Även Om flera tusen små RNAs har identifierats från olika växt- och djursystem, ordnar dessa identifierades genom att använda äldre teknologier som inte ordnar djupt nog för att karakterisera dessa molekylar på ettsned boll fjäll. Kvantitativ information om överflödet och regleringen av majoriteten av små RNAs också har saknat.
Med finansiering från Nationalet Science Foundation övervann laboratoriumna av Gräsplan och Meyers, som inhysas på det Delaware BioteknikInstitutet, dessa hinder att göra ett genombrott i studien av små RNAs från Arabidopsis.
Före deras arbete hade forskare över hela världen i ett painstakingly långsamt och arbetsintensivt processaa dokumenterat omkring 6.000 små RNAs från växten.
Meyers hade ordnat RNAs i rice och Arabidopsis genom att använda MPSS, då Gräsplan att närma sig honom om möjligheten av att ordna små RNAs genom att använda MPSS-teknologin.
”Visste Vi att MPSS kunde fungera i att ordna små RNAs men vi inte var säkra hur att intressera resultatet skulle är,”, sade Meyers. ”Men, så snart som vi mottog den första färdiga datamängden, sågar vi snabbt, att den var långt rikare och mer komplex, än någon hade föregående frambragt för denna typ av molekylen.”,
Som projektera fortskred, ordnade identifierade laboratoriumna omkring 2,2 miljon små RNAs från plantorna och blommorna av växten och mer, olik liten RNA än 75.000 ordnar.
”Gör Inte endast MPSS ger mycket djup täckning av små RNAs, utan den ger också kvantitativ information,”, Göra Grön sade och att tillfoga det, ”som detta tillåtet många reglerade högt små RNAs som ska identifieras.”,
Förutom det rent numrera av ordnar identifierat, sade Meyers att ”den största överrrakningen i rönet är mångfalden.”, Han sade att deras data indikerade att regionerna av kromosomerna, var folket hade spekulerat där inte var mycket transcriptional aktivitet som ut vändes för att vara platser av enorma belopp av liten RNAaktivitet.