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重大的預付款在小的核糖核酸的研究中

Published on September 5, 2005 at 6:29 AM · No Comments

特拉華大學的科學家在這個工廠 Arabidopsis 中在小的核糖核酸 (RNAs) 的研究中比以前被識別做重大的預付款,發現 10 倍更小的 RNAs。 預付款在科學雜誌的 9月 2日問題報告。

這個研究在最後一年半中開展了由從帕梅拉的實驗室的小組 J. Green,在工廠分子生物學、聯合預約在工廠和土壤科學的部門和海洋研究學院和布雷克工廠 C. Meyers的克勞福德 H. Greenewalt Endowed 的椅子帶領助理教授和土壤科學在農業和自然資源學院。

要識別小的 RNAs,科學家使用大量稱排序並行的簽名的 transcriptional 描出的技術 (MPSS),由 Solexa Hayward Inc. 開發,加利福尼亞。

綠色和 Meyers 作早期工作在 MPSS 的應用對小的 RNAs 與科學家合作在 Solexa。

綠色說小的 RNAs 是 「多數重要發現之一在生物工藝學方面在最近 10 年」,因為他們在調控的基因扮演一個重要角色在植物和動物。

在小的核糖核酸生產的缺乏可能有對發展的深刻作用,并且小的 RNAs 與其他重要生物學過程相關,例如對重點的回應。

確定有機體的小的 RNAs 的順序為瞭解他們的整體影響是重要的,并且各自的生物角色, Meyers 說。

雖然數千小的 RNAs 從不同的植物和動物系統被識別,這些順序被識別使用不排序足够深深地分析在一染色體等級的這些分子的更舊的技術。 關於大部分的豐盈和管理規定的定量信息小的 RNAs 也缺乏。

從國家科學基金會的資助,綠色實驗室和 Meyers,在特拉華生物工藝學學院被安置,在小的 RNAs 的研究中克服了這些阻礙由 Arabidopsis 做突破。

在他們的工作之前,全世界科學家在一個刻苦緩慢和勞動強度進程中提供了大約 6,000 從這個工廠的小的 RNAs。

使用 MPSS 技術,當綠色處理他關於排序小的 RNAs 的可能性 Meyers 排序在米的 RNAs 和 Arabidopsis 使用 MPSS。

「我們知道 MPSS 在排序可能運作小的 RNAs,但是我們不是肯定的多麼有趣這個結果是」, Meyers 說。 「但是,當我們接受了第一完全數據集,我們迅速看見它比任何人為此種分子更加富有和複雜以前生成了」。

當這個項目繼續進行,實驗室排序大約 2.2 從這個工廠的幼木和花的百萬小的 RNAs 并且識別超過 75,000 個不同小的核糖核酸順序。

「不僅 MPSS 提供非常小的 RNAs 深刻的覆蓋範圍,但是它也提供定量信息」,這准許許多高度調控將被識別的小的 RNAs 的 Green 說,添加那 「」。

除被識別的順序之外的純粹數量, Meyers 說 「在發現的最大的驚奇是分集」。 他說他們的數據表明人們推測染色體的地區那裡不是結果的 transcriptional 活動是極大的數量站點小的核糖核酸活動。

綠色說他們的發現的涵義將由他們的實驗室和那些有對將來的研究的重要影響在其他機構。 「什麼我們查找了是期初,因為分枝去在那之外的方式」,她說。 「許多將來的興奮將起因於不同的實驗室試驗新的想法在查看數據以後他們偏愛的基因或染色體地區的」。 她解釋學科領域興旺,因為小的 RNAs 是重要的在他們的很大數量的基因的管理規定在複雜生物系統的。 一個小的核糖核酸可能調控多基因,并且研究員相信更多 than10 百分比的人力基因是由小的 RNAs 調控的。

小的 RNAs 描繪為大約 21 到 24 核苷酸的長度。 小的 RNAs 的生物活動首先被描述了大約 12 年前,但是在此域的最大量的預付款在最近六或七年只做。

要協助解決其他小的核糖核酸研究員, UD 小組創建一個用戶友好網站 [http://mpss.udel.edu/at] 可用對科學家檢查 Arabidopsis 染色體的所有基因或區域符合的到小的 RNAs。

科學是科學的推進的美國關聯發布的一個有名望的日記帳。 本文的第一和第二作者是城 Lu,分子生物學博士後和 Shivakundan 辛哈 Tej,計算機科學學員。 除綠色和 Meyers 之外,並且在作者中,是 Solexa 的 Shujun 羅和基督徒 D. Haudenschild。

「通過一起接近從事和與行業合作者」, Green 說, 「學員和 postdocs 過了他們的常規培訓限定範圍。 這模擬 UD 和 DBI 的目標學科研究、教育和經濟發展的」。

除由 NSF 的資助之外,實驗室從 DBI 在小的核糖核酸分析接受授予和美國農業部繼續他們的工作。

http://www.udel.edu/