Volgens de gezondheid van de ambtenaren, heeft een zeldzame muggen overgedragen ziekte doodde een jong meisje en een oudere man die leefde in naburige steden, en ze zijn om mensen ertoe aan om zichzelf te beschermen tegen de insecten.
De twee slachtoffers werden ziek met de gevaarlijke Eastern equine encephalitis virus, bekend als EEE, binnen een paar dagen van een derde vrouw die ook in de buurt woont.
Ze is in een ernstige aandoening, zeggen ambtenaren.
In de afgelopen weken vier New Hampshire bewoners hebben ook ziek geworden met het virus, maar niets zijn gestorven.
Dr Al Demaria, state-directeur van overdraagbare ziekte onder controle, zegt dat het onduidelijk is hoe of wanneer de ziekte werd gecontracteerd door het 5-jarig meisje en de 83-jarige man, die leefde in het zuidoosten van de staat arm.
Demaria zegt dat het is van cruciaal belang dat de bewoners zelf te beschermen tegen muggenbeten, zoals muggen zullen bijten tot aan de eerste vorst verschijnt.
Volgens de federale Centers for Disease Control and Prevention , zijn er slechts 200 gevallen van bevestigde EEA sinds 1964 in de Verenigde Staten.
In de regel de ziekte doodt ongeveer 35 procent van de mensen die het contract, en veroorzaakt milde tot ernstige neurologische problemen in nog eens 35 procent.
Symptomen die variëren van milde griepachtige ziekte met ontsteking van de hersenen, kan leiden tot coma en de dood.
Tot op heden is er geen licentie vaccin voor de mens. Het virus heeft ook invloed op vogels en paarden.
Het jonge meisje, uit Halifax, werd ziek op 26 augustus en overleed op 4 september. Hoewel het lab tests later geïdentificeerd van de ziekte, zijn de resultaten van een eindtoets in afwachting van.
De man, van Kingston, werd ziek op 21 augustus en stierf vijf dagen later.
Tests bevestigden de ziekte een week na zijn dood.
Vorig jaar, Massachusetts had vier bevestigde menselijke gevallen EEE, twee van hen fataal.
Massachusetts is een van de staten die heeft het grootste aantal gevallen, andere zijn Florida, Georgia en New Jersey.
Sinds vorige week, had de staat getest rond 120.000 muggen voor de EEE, en slechts 15 positief getest op het virus.