Novel bruk av genetisk testing metoder hjulpet offentlige helsemyndigheter kontroll og begrense videre spredning av fire utbrudd av matbåren hepatitt A virus i 2003 knyttet til forbruk av grønne løk, i henhold til en detaljert analyse publisert i den 15 oktober utgaven av The Journal of Infectious Sykdommer , nå tilgjengelig på nettet.
Forfatterne av studien, Joseph J. Amon, PhD, MSPH, og kolleger ved Centers for Disease Control and Prevention (CDC) , forklarte at disse molekylære epidemiologiske metoder ikke hadde tidligere vært brukt i en pågående undersøkelse av hepatitt A-virus utbrudd . Metodene, som involverer genetisk sekvensering analyse av virus funnet i blodprøver fra infiserte individer, har kraftig forbedret forståelse av utbrudd av andre matbårne patogener, men er tidkrevende og ikke allment tilgjengelig.
I september 2003 rapporterte Tennessee, North Carolina og Georgia totalt 422 tilfeller av matbåren hepatitt A virus smitte til CDC. Foreløpige undersøkelser antydet clustering av rapporterte tilfeller blant beskyttere av tre urelaterte restauranter. Etterforskerne identifisert grønn løk som den sannsynlige årsaken i utbruddet ved å intervjue smittede og usmittede restaurant beskyttere. I tillegg til disse standard teknikker, forskerne også sammenlignet viral RNA sekvenser fra sak pasienter og enkeltpersoner samtidig syk med hepatitt A virus infeksjon hos ikke-utbruddet innstillinger i USA og Mexico.
Viral RNA sekvenser fra pasienter i de tre statene, pluss pasienter involvert i et påfølgende utbrudd i Pennsylvania i oktober 2003 (sistnevnte nylig beskrevet i den første september nummer av New England Journal of Medicine), ble litt forskjellig fra hverandre. The viral sekvens fra hver utbrudd var imidlertid identisk med en eller flere sekvenser isolert fra Nord meksikanske innbyggere smittet med hepatitt A virus. Forskerne konkluderte med at kildene til den grønne løk serveres i restauranter i Tennessee og Georgia var tre gårder i det nordlige Mexico.