I aldrig tidigare skådad ny forskning har forskare på RiceUniversitetar kombinerat teori och experimenterar för den första tiden till både förutsäger teoretiskt och verifierar försöksvis denvikning dynamiken av ett stort komplext protein.
Den tvärvetenskapliga forskningen visas baksida mot baksida legitimationshandlingar för denna vecka itu i Förfarandena av MedborgareAkademin av Vetenskaper.
”Har Forskare lyckat kombinerat datoren som modellerar, och experimentella resultat i hopfällbara studier för lilla proteiner, men denna är den första effektiva kombinationen för ett stort, mång--området protein,”, sade studieco-författare Kathleen Matthews, Skolar Dekanen av Wiessen av Naturliga Vetenskaper och Stewart den Minnes- Professorn av Biochemistry. ”Krävdes Banbrytande försök att upprätta jämförbara experimentella och teoretiska data, och metoden som remarkably väl fungerades. Vi förväntar andra för att adoptera den i deras egna studier.”,
Proteiner är workhorsesna av biologi. På någon given tid förkroppsligar varje cell i vårt innehåller 10.000 eller mer av dem. Varje av dessa proteiner är en kedja av strängde amino syror avsluta-till-avslutar likt pryder med pärlor i halsband. För längre proteiner kan kedja innehålla hundratals amino syror.
Tack till modern genomics, forskare kan använda DNA för att dechiffrera den amino syran ordnar i ett protein. Men när du vet ordna ger ingen ledtråd till proteinet fungerar, därför att fungera binds inextricably för att forma, och varje protein själv-monterar in i dess kännetecken formar understöder within av att skapas.
”Bildar vikt, funktionellt av proteinet är vad betyder egentligen, och vårt intressera är, i att skapa ett hopfällbart kretsschema av, sorterar, en täppa av den thermodynamic rutten, som proteinet följer som den flyttningar in mot equilibrium,” sade co-författare Cecilia Clementi, den Normandiska Hackerman-Walesiska Unga UtredareAssistentProfessorn av Kemi.
Riceforskninglaget inklusive Clementi, Clementis doktorand Payel Das, experimentalist Pernilla Wittung-Stafshede, förbunden professor av biochemistry och cellbiologi, Matthews och doktorand Corey Wilson av biochemistry och cellbiologi.
”Vet Vi att misfolded proteiner leker en nyckel- men mystisk roll i Alzheimers, Parkinsons, sockersjuka och en vara värd av andra sjukdomar, så kartlägga det normalarutten är takes för ett protein - och finna av-ramperna som kan bly- till misfolding - absolut nödvändigt viktiga,”, sade Wittung-Stafshede.
Rices studier bars ut på monomeric lactoserepressorprotein eller MLAc, en variant av proteinet som användes av Escherichia Coli för att reglera uttryckt av proteinerna som transporterar och metabolize lactose. MLAc innehåller omkring 360 amino syror.