Mananaliksik sa UCSD natuklasan na ang mga single-cell na limatik na responsable para sa isang tinatayang 1 milyong mga pagkamatay sa bawat taon sa buong mundo mula sa malarya ay protina na "mga kable" na naiiba kitang-kita mula sa cellular circuitry ng iba pang mas mataas na organismo, ang isang paghahanap na maaaring humantong sa pagbuo ng antimalarial mga gamot na samantalahin na pagkakaiba.
Ang mga siyentipiko ay ulat sa ang isyu Nobyembre 3 ng Kalikasan ng isang paghahambing ng mga bagong natuklasan na protina-mga pakikipag-ugnayan sa Plasmodium falciparum sa pakikipag-ugnayan ng protina ay iniulat na mas maaga sa apat na iba pang na rin mga aral na modelo organismo - lebadura, ang isang nematode worm, prutas lumipad, at isang bacterium na sanhi ng ulcers ng pagtunaw-lagay sa mga tao. Ang mga may-akda ng ang pag-aaral, trey Ideker, isang propesor ng bioengineering sa UCSD Jacobs School of Engineering, at dalawang graduate mag-aaral, Silpa Suthram at Taylor Sittler, sinabi protina pakikipag-ugnayan ng malarya parasito "itakda ito hiwalay mula sa iba pang species."
"Namin kilala dahil sa ang Plasmodium genome ay sequenced tatlong taon na nakalipas na ang 40 porsyento ng mga nito 5300 proteins ay makabuluhang katulad, o homologo, sa mga proteins sa iba pang mga eukaryotes, ngunit hanggang ngayon ay hindi namin alam na ang malarya parasito assembles mga proteins upang katangi-tangi, "sabi Ideker. "Dahil ang aming naunang pananaliksik ay nagpakita na ang lebadura, worm, at lumipad ang daan-daang ng parehong conserved proteins at mga pakikipag-ugnayan ng protina, hindi namin ginawa simula naniniwala ang aming sariling pagtatasa, na kung saan ay nagpakita na may lamang tatlong Plasmodium protina pakikipag-ugnayan sa mga karaniwang may pampaalsa at wala sa karaniwan na may iba pang species-aral. " Ang World Health Organization warns malarya ay isang lumalagong pananakot sa pandaigdigang kalusugan, lalo na sa mga mahihirap na bansa. Walang malarya bakuna ay binuo, at sabay malakas na mga antimalarial gamot ay mas mababa at mas epektibo dahil Plasmodium falciparum ay bumuo ng pagtutol sa mga gamot. Kahit lamok na magpadala ng malarya ay pagbuo ng pagtutol sa mga pinaka-karaniwang ginagamit insecticides.
"Ang pagpapakita na ang network ng protina ng Plasmodium ay naiiba makabuluhang mula sa mga ng ilang mga organismo ng modelo ay isang nakakaintriga resulta na maaaring humantong sa pagkilala ng mga nobelang nagta-target ng gamot para sa labanan malarya," sabi ni John Whitmarsh, kumikilos director ng Center para sa Bioinformatics at Computational Biology sa sa National Institute ng General Medical Sciences, na bahagyang pinondohan ang trabaho. "Ideker at ang kanyang koponan ay ipinapakita ang pagiging epektibo ng isang computational diskarte na batay sa matematika para sa unawa ng mga kumplikadong biological mga pakikipag-ugnayan."
Ang mga mananaliksik na pag-aaral ng protina expression sa ilalim ng kontroladong kondisyon laboratoryo pinabagal dahil ang mga pamamaraan na dinisenyo para sa iba pang mga organismo mahina sa Plasmodium dahil sa ang 80 porsiyento ng kanyang genome ay binubuo ng dalawang lamang sa apat na mga bloke ng gusali ng DNA.
Stanly Fields, isang propesor ng genomic agham sa University of Washington na imbento ng isang mapanlikha paraan upang makilala ang mga pares ng mga proteins na pisikal na makipag-ugnayan sa bawat isa, binago ang kanyang pamamaraan at nagdagdag ng espesyal na mga kondisyon kultura upang paganahin ang kanyang grupo sa pag-aaral ang Plasmodium. Patlang koponan at nakikipagtulungan sa Prolexys parmasyutiko ng Salt Lake City, UT, ay natuklasan ng 2846 mga pakikipag-ugnayan sa may kinalaman sa 1312 Plasmodium falciparum proteins. Ng koponan ang mga na ibinigay ng mga data sa mga pakikipag-ugnayan sa Ideker ng group mas maaga at din iniulat ang mga resulta sa ang isyu Nobyembre 3 ng Kalikasan.