Ακολουθία διαφορές σε λιγότερο από 0,2% του 3-δις-βάσης ανθρώπινου γονιδιώματος διαδραματίζουν ζωτικό ρόλο σε μια απίστευτη ποικιλία των ανθρώπινων ασθενειών. Ερευνητές από το Wellcome Trust Sanger Institute και το Πανεπιστήμιο του Cambridge του Cambridge Ινστιτούτο Ιατρικών Ερευνών , μαζί με τους διεθνείς συνεργάτες του αναφέρουν στο PLoS Genetics λεπτομερείς χάρτες τους τις διαφορές που εμπλέκονται στην ασθένεια, καθώς τα γονίδια τα οποία παραμένουν αμετάβλητα στην πρόσφατη ανθρώπινη ιστορία.
Η μείζονος συμπλέγματος ιστοσυμβατότητας (MHC) αποτελείται από τις εκατοντάδες των γονιδίων στην ανθρώπινη χρωμοσώματος 6 που είναι σημαντικά στις περισσότερες αυτοάνοσες καταστάσεις, όταν η βιολογική μας άμυνες ενεργοποιήσετε τα δικά τους συστήματα μας. Η MHC έχει τον κύριο ρόλο στο διαβήτη τύπου 1 και η ρευματοειδής αρθρίτιδα. Η MHC είναι επίσης καθοριστική για την αντιμετώπιση λοιμώξεων, συμπεριλαμβανομένων της ελονοσίας και του AIDS.
Τα γονίδια του MHC μπορεί να διαφέρουν δραματικά μεταξύ των ανθρώπων, και οι διαφορές μεταξύ μας επηρεάζουν ιατρικά περιστατικά τόσο διαφορετικές όσο η απόρριψη του μοσχεύματος ιστών, αρθρίτιδα, το άσθμα και την ανθεκτικότητα στις ασθένειες. Μια λεπτομερής μελέτη αυτής της περιοχής σε διαφορετικούς ανθρώπους, θα ρίξει φως σε ποια γονίδια είναι τα πιο σημαντικά.
«Αναλύσαμε το σύνολο της περιοχής MHC λεπτομερώς από τρία άτομα που μεταφέρονται διαφορετικές ευάλωτους στις ασθένειες,» εξήγησε ο Δρ Stephan Beck, επικεφαλής της ομάδας στο Wellcome Trust Sanger Institute. Βασικές διαφορές στη συνέχεια θα αναλυθούν διεξοδικότερα σε ένα πολύ μεγαλύτερο πληθυσμό από 140 δείγματα DNA.
«Μέσα στη θάλασσα πάνω από 20.000 παραλλαγές σε όλη την ακολουθία των 4 εκατομμυρίων MHC βάσεις, βρήκαμε ένα νησί της σταθερότητας», συνέχισε ο Δρ Beck. "Μια περιοχή των 160.000 βάσεις που είναι μέχρι και 200 φορές λιγότερο παραλλαγή μεταξύ χρωμοσώματα μοιράζονται μέρος του ίδιου τύπου HLA, γεγονός που υποδηλώνει τα άτομα αυτά κατά πάσα πιθανότητα είχαν κοινό πρόγονο, όπως πρόσφατα ως 50.000 χρόνια πριν."
Εναλλαγή των προγόνων μπλοκ ακολουθία είναι ένα δυναμικό μηχανισμό (ταυτότητα-προς-κάθοδος) με την οποία ορισμένοι συνδυασμοί γονιδίων, οι οποίες έχουν προφανώς ευνοούσε πλεονέκτημα ανοσολογικές (π.χ. αντίσταση σε μολυσματικές ασθένειες), μπορεί να εξαπλωθεί σε όλη την απλοτύπων και πληθυσμούς.
Ο καθηγητής Τζον Trowsdale, στο Τμήμα Παθολογίας του Πανεπιστημίου του Καίμπριτζ, δήλωσε: «Η περιοχή, που ονομάζεται DR-DQ, όπου θα βρούμε αυτό το νησί της σταθερότητας είναι ένα από τα πιο μεταβλητή στο γονιδίωμά μας, αλλά σε μερικά άτομα έχουν« σταθερό ». Προτείνουμε να έχουν προγονικό DR-DQ μπλοκ έχουν ανακατευτεί σε διάφορα MHC υπόβαθρο και στη συνέχεια επεκτάθηκε σε συχνότητα μεταξύ των ευρωπαϊκών πληθυσμών.
«Αυτά τα« σταθερό »απλότυπους μπορεί στη συνέχεια να επεκταθεί, επειδή προστατεύονται από λοιμώξεις και τις ασθένειες. Ελπίζουμε να δείξουμε, με περαιτέρω μελέτες, αν αυτή η σταθερή περιοχή ήταν το κλειδί για την ανθεκτικότητα στις ασθένειες στο πρόσφατο παρελθόν μας. "
Η μελέτη περιγράφονται περαιτέρω πάνω από 300 αμινοξέα αλλαγή παραλλαγές σε γονιδιακές αλληλουχίες. Οι παραλλαγές αυτές είναι ισχυροί υποψήφιοι για λειτουργικές μελέτες για την κατανόηση του ρόλου της μεταβολής MHC που σχετίζονται με ασθένειες.
Αυτοάνοση νόσος προσβάλλει περίπου 3 εκατομμύρια ανθρώπους στο Ηνωμένο Βασίλειο. Οι τρεις απλότυποι μελετηθεί εδώ εμφανίζει διαφορετικές ευαισθησίες σε ασθένειες όπως ο διαβήτης τύπου 1, βαριά μυασθένεια και σκλήρυνση κατά πλάκας.
Για μερικές κοινές αυτοάνοσες παθήσεις του MHC προσφέρει με διαφορά η μεγαλύτερη γενετική συμβολή από μία και μόνη περιφέρεια χρωμόσωμα. Για παράδειγμα, η MHC αντιπροσωπεύει τουλάχιστον το 30% του οικογενούς συγκέντρωσης στο διαβήτη τύπου 1 και η ρευματοειδής αρθρίτιδα.