Differenze di Sequenza in meno di 0,2% del gioco del genoma umano di 3 miliardo-basi un ruolo vitale in una varietà sconcertante di malattia umana. Ricercatori dall'Istituto di Sanger di Fiducia di Wellcome e dall'Istituto di Cambridge dell'Università di Cambridge per Ricerca Medica, insieme al rapporto internazionale dei colleghi nella Genetica di PLoS le loro mappe dettagliate delle differenze implicate nella malattia come pure in geni che sono immutate in storia dell'umanità recente.
Il Complesso Principale di Istocompatibilità (MHC) consiste delle centinaia di geni sul cromosoma umano 6 che sono importanti nella maggior parte delle circostanze autoimmuni, quando le nostre difese biologiche accendono i nostri propri sistemi. Il MHC ha il ruolo principale nel diabete di tipo 1 e nell'artrite reumatoide. Il MHC è egualmente chiave in risposta all'infezione, compreso malaria e l'AIDS.
I Geni nel MHC possono differire drammaticamente fra la gente e le differenze fra noi eventi medici di influenza diversi quanto la resistenza del rigetto, di artrite, di asma e di malattia del tessuto. Uno studio dettagliato su questa regione in gente differente farà luce su quali geni sono più importanti.
“Abbiamo analizzato dettagliatamente l'intera regione di MHC da tre persone che hanno portato la predisposizione differente alla malattia,„ il Dott. spiegato Stephan Beck, guida del gruppo all'Istituto di Sanger della Fiducia di Wellcome. Le differenze Chiave erano poi più ancora analizzate in una popolazione molto più grande di 140 campioni del DNA.
“All'interno del mare oltre delle 20.000 variazioni di sequenza attraverso le 4 milione basi di MHC, abbiamo trovato un'isola della stabilità,„ il Dott. continuato Beck. “Una regione di 160.000 basi che è fino a 200 volta meno variante fra i cromosomi che dividono la parte dello stesso tipo di HLA, suggerente che queste persone molto probabilmente abbiano diviso un antenato comune ancora in 50.000 anni fa.„
Il Cambio dei blocchetti ancestrali di sequenza è un meccanismo potenziale (identità-da-discesa) con cui determinate combinazioni del gene, che presumibilmente hanno favorito il vantaggio immunologico (per esempio resistenza alla malattia infettiva), possono spargersi di attraverso gli aplotipi e le popolazioni.
Il Professor John Trowsdale, al Dipartimento di Patologia, Università di Cambridge, ha detto, “La regione, chiamata DR-DQ, dove troviamo questa isola della stabilità è una dei più variabili in nostro genoma, eppure qualche gente che è stato ` fissato'. Suggeriamo che i blocchetti di DR-DQ ancestrali siano stati mescolati negli ambiti di provenienza differenti di MHC e successivamente siano stati ampliati nella frequenza attraverso le popolazioni Europee.
“Questi' aplotipi fissi ` potrebbero poi espandersi perché essi protetti contro l'infezione e la malattia. Speriamo di mostrare, in ulteriori studi, se questa regione stabile sia stata un tasto alla resistenza di malattia nella nostra esperienza recente.„
Il più ancora di studio descritto oltre 300 varianti cambianti dell'amminoacido nelle sequenze del gene. Queste varianti sono forti candidati affinchè gli studi funzionali capiscano il ruolo della variazione nella malattia MHC-associata.
Influenze di malattia Autoimmune circa 3 milione di persone nel REGNO UNITO. I tre aplotipi studiati qui video le predisposizioni differenti alle malattie quali il diabete di tipo 1, le miastenie gravis e la sclerosi a placche.
Per alcune malattie autoimmuni comuni il MHC fornisce il contributo genetico di gran lunga più grande da una singola regione del cromosoma. Per esempio, il MHC rappresenta almeno 30% dell'aggregazione familiare nel diabete di tipo 1 e nell'artrite reumatoide.