Sinds de genoomopeenvolging van de bacteriële ziekteverwekker Hemophilus - influenzae werden gepubliceerd in 1995, de genetische complexe code van veel andere groot, medisch, en de commercieel significante organismen met inbegrip van mensen is ook nader toegelicht.
Nochtans, zijn de technieken worden gebruikt om deze genetische opeenvolgingen af te leiden onvolmaakt, en vele onderzoekers kunnen van potentiële fouten onbewust zijn openbaar sluimerend binnen - beschikbare gepubliceerde, of „canonieke“ opeenvolging die. Als het genoom van een organisme onstabiel is, veranderlijk, en herschikkingen binnen een bevolking of tussen spanningen bevat, kan er geen ware lineaire structuur zijn die voor dat organisme geldig zal zijn, en opleggen van een lineaire opeenvolging kan niet biologisch zinvol zijn.
Nu, beschrijven de onderzoekers bij de het Koude Laboratorium van de Haven van de Lente en Universiteit van New York een hoge productie microarray techniek die gelijktijdig het testen van vele steekproeven impliceert en die kan worden gebruikt om fysieke kaarten te assembleren en genomic opeenvolgingsassemblage te bevestigen. De bevindingen verschijnen in de recentste kwestie van het Dagboek van ComputerBiologie.
Het onderzoek werd geleid door Joseph West, John Healy, en Michael Wigler of het Koude Laboratorium van de Haven van de Lente, en William Casey en Knop Mishra van het Instituut Courant van NYU van Wiskundige Wetenschappen. Mishra is een Professor van de Wetenschap en de Wiskunde van de Computer bij het Instituut Courant en heeft ook een benoeming in het Ministerie van de Biologie van de Cel op de School van NYU van Geneeskunde.
Gebruikend hun micro-serie kruisingsmethode, die flourescently geëtiketteerde die fragmenten van het genoom van de splitsingsgist S. pombe gebruikte en onderzocht hoe zij aan sondes binden op een glasplaatje worden opgesteld, konden zij de „afstand“ tussen sondes in het genoom met behulp van computer afleiden en de sondes langs het genoom organiseren. De resulterende fysieke kaart van het genoom van S. werd pombe vergeleken bij de overeenkomstige die kaart gegevens wordt verwerkt van openbaar - de beschikbare opeenvolging van S. pombe. De vergelijking toonde een klein aantal significante discrepantie tussen hun die resultaten en dat van de kaart uit de openbare die opeenvolging wordt afgeleid in 2002 wordt vrijgegeven. S. pombe is het genoom slechts ongeveer 14 miljoen lange basissen (bijna duizendste van het menselijke genoom), en een gouden-norm in geheel-genoomassemblage wijd als beschouwd.