Da Quando la sequenza del genoma di Hemophilus Influenzae batterico dell'agente patogeno è stata pubblicata nel 1995, il codice genetico molti altro grande, complesso, medicamente e degli organismi commercialmente significativi compreso gli esseri umani egualmente è stato delucidato.
Tuttavia, le tecniche usate per derivare queste sequenze genetiche sono imperfette e molti ricercatori possono essere ignari degli errori potenziali che si appostano pubblicamente all'interno - della sequenza pubblicata e o “canonica„ disponibile. Se il genoma di un organismo è instabile, variabile e contiene le riorganizzazioni all'interno di una popolazione o fra gli sforzi, ci può essere struttura lineare non vera che sarà valida per quell'organismo ed imporre una sequenza lineare non può essere biologicamente significativa.
Ora, i ricercatori al Laboratorio Freddo del Porto della Sorgente e la New York University descrivono un'alta tecnica di microarray di capacità di lavorazione che comprende provare molti campioni simultaneamente e che può essere usata per montare le mappe fisiche e per convalidare gli assembly genomica di sequenza. I risultati compaiono nell'ultima edizione del Giornale di Biologia Di Calcolo.
La ricerca è stata condotta da Joseph Verso Ovest, da John Healy e da Michael Wigler del Laboratorio Freddo del Porto della Sorgente e William Casey ed il Germoglio Mishra dell'Istituto del Courant di NYU delle Scienze Matematiche. Mishra è il Professor dell'Informatica e della Matematica All'Istituto di Courant ed egualmente ha una nomina nel Dipartimento di Biologia Cellulare alla Scuola di Medicina di NYU.
Facendo Uso del loro metodo di ibridazione di micro-schiera, che ha usato i frammenti flourescently contrassegnati dal genoma del pombe del lievito S. di fissione ed ha esaminato come legano alle sonde allineate su una lastra di vetro, potevano derivare informaticamente “la distanza„ fra le sonde nel genoma ed organizzare le sonde lungo il genoma. La mappa fisica risultante del genoma del pombe dello S. è stata confrontata alla mappa corrispondente computata pubblicamente - dalla sequenza disponibile del pombe dello S. Il confronto ha mostrato che un piccolo numero di discrepanze significative fra i loro risultati e quello della mappa derivata dalla sequenza pubblica ha rilasciato nel 2002. Il genoma dei pombe dello S. è lungamente soltanto circa 14 milione basi (quasi un millesimo del genoma umano) ed ampiamente è considerato come uno d'oro standard in assembly del intero-genoma.