Read in | English | Español | Français | Deutsch | Português | Italiano | 日本語 | 한국어 | 简体中文 | 繁體中文 | Nederlands | Norsk | Русский | Svenska | Polski

Данные по Генома могут содержать малые но значительно ошибки

Published on February 17, 2006 at 1:20 AM · No Comments

С последовательности генома бактериального патогена Hemophilus - influenzae были опубликованы в 1995, генетический Код много других больших, сложный, медицински, и коммерчески значительно организмы включая людей также были разъяснены.

Однако, методы используемые для того чтобы вывести эти генетические последовательности неидеальны, и много исследователей могут быть незнающи потенциальных ошибок скрываясь в пределах публично - доступной опубликованной, или «канонической» последовательности. Если геном организма неустойчив, переменн, и содержит перераспределения внутри населенность или между напряжениями, то могут быть не истинная линейная структура которая будет действительна для того организма, и наводить линейную последовательность не может быть биологически содержателен.

Теперь, исследователя на Холодной Весне Затаивают Лабораторию и Университет Нью Йорка описывает высокий метод microarray объём который включает испытать много образцов одновременно и могущие понадобиться для того чтобы собрать физические карты и утвердить genomic агрегаты последовательности. Заключения появляются в самый последний вопрос Журнала Вычислительной Биологии.

Исследование было дирижировано Иосиф На Запад, Джном Healy, и Майкл Wigler Холодной Лаборатории Гавани Весны, и Вильгельмом Casey и Бутоном Mishra Института Courant NYU Математически Наук. Mishra Профессор Компьутерных Наук и Математики На Институте Courant и также имеет назначение в Отделе Биологии Клетки на Медицинском Факультете NYU.

Используя их метод гибридизации микро--блока, который использовал flourescently обозначенные фрагменты от генома pombe дрождей S. расщепления и рассматривал как они связывают к зондам одетым на стеклянной вставке, они могли вычислительно вывести «расстояние» между зондами в геноме и организовать зонды вдоль генома. Приводя к физическая карта генома pombe S. была сравнена к соответствуя карте вычисленной от публично - доступной последовательности pombe S. Сравнение показало немного значительно несоответствий между их результатами и той из карты выведенной от общественной выпущенной последовательности в 2002. Геном pombe S. только около 14 миллиона основания длиной (почти тысячный из людского генома), и широко рассмотрены, что будет золотым стандартом в агрегате вс-генома.