染色体数据可能包含小，但是重大错误

自从细菌病原生物发否氏杆菌的染色体顺序在 1995年被发布了，许多其他大，复杂，医疗和商业上重大的有机体基因代码包括人也被阐明了。

然而，用于的技术派生这些基因顺序是不完美的，并且可能是没有察觉的对潜在的错误潜伏在这个公共可用的发布或者 “规范”顺序内的许多研究员。 如果有机体的染色体是不稳定，可变的，并且包含重新整理在人口内或在张力之间，可能没有为该有机体将是有效的真的线性结构，并且强加一个线性顺序可能不是生物有意义的。

现在，冷弹簧的研究员怀有实验室，并且纽约大学描述介入同时测试许多范例，并且可以用于装配实际映射和验证基因组顺序集合的一个高处理量微阵列技术。 发现出现于计算生物日记帐的最新的问题。

这个研究由约瑟夫西部，冷弹簧港口实验室的约翰 Healy 和迈克尔 Wigler 和威廉 Casey 和芽 NYU 的数学 Courant 学院 Mishra 开展。 Mishra 是计算机科学和数学教授在 Courant 学院并且有预约在细胞生物学的部门在 NYU 的医学院。

使用他们的微阵列杂交方法，使用 flourescently 从分裂酵母 S. pombe 染色体的被标记的小片并且检查他们如何束缚对在一个载玻片排列的探测，他们能计算上派生 “距离”在这条染色体的探测之间和组织沿这条染色体的探测。 S. pombe 染色体的发生的实际映射与从公共可用的 S. pombe 顺序计算的对应的映射比较。 这个比较在 2002年显示了他们的从这个公共顺序派生的结果和那的很小数量重大的差异映射之间被发行。 S. pombe 的染色体长期是仅大约 14 百万个基础 (几乎第一千分之一人类基因组) 和广泛被认为一金标准的在全部染色体集合。

作者显示那以适当的试验条件，列阵杂交数据可以使用设立唯一排列的探测之间的一个实际距离--在这种情况下是长 70 个基本的对脱氧核糖核酸的顺序。 70 个基本对中的每一个是唯一的在目标有机体的染色体并且担当在该染色体的一个地标。 这些探测在他们在目标染色体发生的正确的顺序可能然后被定购，以与 mapmaker 能找出地标正确的坐标相似的方式通过咨询地理映射的三维翻译。 对的距离地标之间可以用于装配实际映射，作为帮助到顺序集合，或者作为验证顺序集合和指示的错误哪里一个独立方法需要更正。

比较从他们的被推断的探测映射的数据与可用的顺序集合，新的方法提供答案到设立规范和准确顺序或实际映射困难，并且建议数据的二种类型可以被结合回报集合的增加的信心的方式。

此实际映射的技术是简单实施并且是比较便宜的。 通过疾病关连的遗传学研究有重大的商业影响，例如癌症和孤独性可能的。 另外，它补充其他映射，并且排序技术 (即，光学映射的和排序的被开发 Mishra) 和癌症列阵 CGH 学习 (即， Wigler 罗马项目和 Mishra 一个多才多艺的癌症染色体分析项目)。

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