Sedan genom ordnar av den bakterie- pathogenen Hemophilus - influenzae publicerades i 1995, genetisk kod av många andra stora som var komplex, medically, och har inklusive människor för kommersiellt viktiga organismer också belysts.
Emellertid härleder de van vid teknikerna dessa genetiskt ordnar är ofullbordade, och många forskare kan vara omedvetna av potentiella fel som publicly lurar inom - tillgängligt publicerat, eller ”canonical” ordnar. Om en organism genom är instabil, innehåller anstränger variabeln, och rearrangements inom en befolkning eller between, kan det finnas inte riktigt linjärt strukturerar att ska var giltig för den organism, och imponera ordnar ett linjärt kan inte vara biologically meningsfullt.
Nu Fjädrar forskare på Förkylning HamnLaboratoriumet, och den New York Universitetar beskriver en teknik för kickgenomgångsmicroarray som gäller att testa många tar prov samtidigt, och som kan vara van vid monterar läkarundersökning kartlägger och, validera genomic ordnar enheter. Rönet visas i det senast utfärdar av Föra Journal över av Computational Biologi.
Forskningen förades av Västra Joseph, John Healy, och Michael Wigler av Förkylning Fjädrar HamnLaboratoriumet och William Casey och Knoppen Mishra av NYUS det Courant Institutet av Matematiska Vetenskaper. Mishra är en Professor av Datavetenskap och Matematik på det Courant Institutet och har också en tidsbeställning i Avdelningen av CellBiologi på NYU att Skola av Medicin.
Genom Att Använda deras mikro-samling hybridizationmetod, som använde flourescently märkta snippets från genom av pomben för fissionjäst S. och undersökte hur dem röran till sonder som ställa i ordning på en glass glidbana, var de kompetent computationally att härleda ”distanserar” mellan sonder i genom och organiserar sonderna längs genom. Den resulterande läkarundersökningen kartlägger av S.-pombegenom jämfördes till motsvara kartlägger beräknat från publicly - tillgänglig S.-pombe ordnar. Jämförelsen visade att ett litet nummer av viktiga diskrepanser mellan deras resultat och det av kartlägga som härledas från allmänheten ordna utsläppt i 2002. S.-pombes genom är endast omkring 14 miljon baser long (nästan en tusendel av människagenom) och är brett ansedd att vara en guldmyntfot i hel-genom enhet.